内蒙古大学哈达组:miRNA在大豆感染SMV病毒中的作用

【字体: 时间:2017年08月29日 来源:联川生物

编辑推荐:

  SMV(大豆花叶病毒)是大豆中最常见的病毒,本研究利用miRNA芯片技术分析并鉴定了SMV易感大豆品系中数十种SMV响应的miRNA,并通过后续qRT-PCR及Northern blot验证。

  

植物通过几种不同的防御机制保护自己免受病毒感染。RNA干扰(RNAi)是一个突出的抗病毒机制,需要AGO(Argonaute)和Dicer / DCL(Dicer-like)蛋白的参与。效应物触发免疫(ETI)是由抗性(R)基因介导的抗病毒机制,其中大部分编码NBS-LRR家族蛋白。microRNAs(miRNAs)在植物中发挥着非常重要的调节作用,包括调节宿主防御机制等。

SMV(大豆花叶病毒)是大豆中最常见的病毒,本研究利用miRNA芯片技术分析并鉴定了SMV易感大豆品系中数十种SMV响应的miRNA,并通过后续qRT-PCR及Northern blot验证。

芯片检测SMV感染组与对照组,共检测到44个差异表达miRNAs,其中上调29个,下调15个。在上调的miRNAs中,miR168a,miR403a,miR162b和miR1515a可能调控AGO1,AGO2,DCL1和DCL2的表达;miR1507a,miR1507c和miR482a可能调控几种NBS-LRR家族疾病抗性基因的表达。通过瞬时表达测定和RLM-RACE实验验证了这7种miRNAs对其靶基因表达的调控作用。SMV感染后不同时间点,AGO1,DCL1,DCL2和5个NBS-LRR家族基因的转录水平被抑制,而相对应的miRNA水平上调。通过STTM技术抑制miR1507a,miR1507c,miR482a,miR168a和miR1515a活性,可减缓SMV感染效率。


 
图 miRNA芯片鉴定分析SMV响应的miRNA

本研究结果表明,通过诱导其相对应的miRNA的积累,SMV可以通过下调几种RNAi通路基因和NBS-LRR家族抗性基因来阻碍大豆防御反应。

参考文献
Bao Duran,et al.(2017) Downregulation of genes coding for core RNAi components and disease resistance proteins via corresponding microRNAs might be correlated with successful SMV infection in soybean. Molecular Plant Pathology. doi: 10.1111/mpp.12581

本研究中的miRNA芯片服务由联川生物提供。

联川生物为研究人员提供从miRNA鉴定到靶基因功能分析的一站式解决方案

获取更多用户研究案例,请访问www.lc-bio.com或拨打咨询热线0571-87662413
 
关于联川生物
联川生物成立于2006年,经过多年的快速发展,已成为业界领先的多组学技术服务商。公司拥有具有自主知识产权的µParaflo®微流体定制化芯片平台,可以为科研用户提供从基因组,转录组,到蛋白组的高通量定制化表达谱芯片解决方案。我们是全球首家提供microRNA表达谱芯片分析的服务商。作为国内最早提供高通量测序技术服务的公司之一,联川生物拥有经验丰富的技术团队和一流的生物信息学专家组,可以为研究人员提供多组学测序服务和深度个性化数据分析解决方案。为满足研究人员跨组学高通量研究需求,联川生物已将蛋白质组定量分析引入技术服务线,为用户提供贯穿中心法则的全程解决方案。多年来,联川生物一直与国内的科研团队保持着长期紧密的合作,助力科研人员在生物、医学、和农林领域的科学发现。全球科研用户使用联川生物的优质科研服务和高质量组学实验数据已发表了逾1000篇 高水平研究论文,其中已在Cell,Nature,Science系列顶级期刊上发表论文30余篇。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 搜索
  • 国际
  • 国内
  • 人物
  • 产业
  • 热点
  • 科普
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号