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iSeq 100测序仪与它的前辈们有何不同?

【字体: www.ebiotrade.com 时间:2018年1月22日 来源:生物通

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  两年后,还是在摩根大通医疗保健大会上,Illumina的现任CEO Francis deSouza宣布推出iSeq 100仪器——萤火虫计划的成果。这台仪器在美国的售价为19,900美元,也是Illumina有史以来最小巧的测序仪。

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在Illumina测序仪的内部,核心组件都是高性能的荧光显微镜。当单个碱基不断掺入产生基因组测序数据时,这种技术能够对每个碱基进行成像,并给出序列信息。围绕此技术,Illumina推出了一系列的测序仪,从MiniSeq和MiSeq(及其表亲MiSeqDx),到NextSeq和各种HiSeq,以及最新的NovaSeq。

两年前,Illumina宣布了萤火虫计划(Project Firefly),其目标是开发出一款仪器,在不依赖光学元件的前提下开展测序,从而让仪器更紧凑、更坚固,而且价格更低。当时的CEO Jay Flatley在摩根大通医疗保健大会上宣布了这一计划。

两年后,还是在摩根大通医疗保健大会上,Illumina的现任CEO Francis deSouza宣布推出iSeq 100仪器——萤火虫计划的成果。这台仪器在美国的售价为19,900美元,也是Illumina有史以来最小巧的测序仪。

iSeq测序仪的主要特征是基于卡盒(cartridge)的操作,从制备好的文库到测序运行开始,时间不到5分钟。您只需将流动槽放入卡盒,然后加入文库,即可开始测序。iSeq的占地面积很小,和笔记本电脑差不多。数据可以上传到Illumina的BaseSpace云平台,开展进一步的分析。

这种一次性的卡盒包含了系统的所有湿式元件,以及互补金属氧化物半导体(CMOS)成像电子元件。图案式流动槽利用Illumina的ExAmp技术在成像元件上立即构建DNA簇。CMOS传感器无法分辨颜色,因此Illumina使用一种染料和两个反应的成像方案。

A和T终止子最先被标记并被成像,然后利用化学反应去除A终止子的标记,并添加C终止子再次成像。因此,将两张图像对比,每轮都亮的是T,只有第一轮亮的是A,只有第二轮亮的是C,两轮都不亮的是G。

据介绍,iSeq 100系统支持多种运行模式,在2x150 bp的读长下,产量达到1.2 Gb,运行时间为17.5小时,卡盒和流动槽的成本约为625美元。deSouza表示,iSeq平台未来将会不断扩展,有望达到10 Gb的产量。此外,运行时间有望缩短50%。

Illumina在推出新仪器的同时,也宣布了与赛默飞的合作,将AmpliSeq多重PCR技术引入Illumina流程。那么,iSeq的客户会有哪些呢?两家公司的合作意味着使用靶向panel的客户可能会成为一个新市场。另外,这个平台还可以应用在基因编辑的验证、传染病监控、小型基因组测序等领域。(生物通 薄荷)

(http://www.ebiotrade.com/)
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