Nature子刊:35个基因塑造了慢性肾病的风险

【字体: 时间:2018年11月28日 来源:生物通

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  目前,慢性肾病的发病率在世界范围内持续升高,大约每十个人中就有一位慢性肾病患者。为此,由曼彻斯特大学科学家领导的研究团队近日开展了全基因组关联研究(GWAS),确定了35个与慢性肾病风险相关的基因。

  

目前,慢性肾病的发病率在世界范围内持续升高,大约每十个人中就有一位慢性肾病患者。为此,由曼彻斯特大学科学家领导的研究团队近日开展了全基因组关联研究(GWAS),确定了35个与慢性肾病风险相关的基因。

这项题为“Molecular insights into genome-wide association studies of chronic kidney disease-defining traits”的研究发表在《Nature Communications》杂志上,有望催生更好的慢性肾病诊断和治疗方法。

资深作者、曼彻斯特大学的Maciej Tomaszewski教授指出:“慢性肾病的遗传因素是很强大的。然而,我们对其确切遗传机制的了解有限,这在部分程度上解释了诊断和治疗方法的开发进程为何如此缓慢。”

在这项研究中,研究人员分析了280个肾脏转录组,以及从44个非肾脏组织中获得的9958个基因表达谱。通过这种方法,他们能够发现88.9%的定义慢性肾病性状的位点的基因表达伙伴(eGene)。

同时,研究人员还利用表观基因组染色质切割分析和变异效应预测来注释74%的慢性肾病位点的功能性后果。“我们的共定位分析和孟德尔随机化分析显示了三个eGene(NAT8B、CASP9和MUC1)对肾小球滤过率估计值的影响,”作者写道。

他们特别提到了MUC1基因,它会导致一种罕见的符合孟德尔遗传规律的肾脏疾病。“我们在MUC1中鉴定出一种常见的选择性剪接变异,并观察到特定的MUC1 mRNA异构体在肾脏中的表达增加,作为一种合理的GWAS关联的分子机制。”

曼彻斯特大学的Adrian Woolf教授评论道:“mucin-1这个基因很有意思。它产生了一种称为粘蛋白的粘性蛋白质,覆盖肾脏内的尿管。这种基因的突变已经在遗传性肾衰竭的家族中发现。”他本人也参与了这项研究。

另一名研究人员、澳大利亚联邦大学的Fadi Charchar教授补充说:“我们希望在症状发展之前通过基因检测进行早期预测,成为预防这种疾病的第一道防线。之后,使用肾脏保护药物治疗或避免可能损害肾脏的药物,从而更好地保护肾脏的健康。”

“慢性肾病之所以被称为慢性杀手,是因为在疾病的后果足够严重之前,它通常没有任何症状。这项研究的结果非常重要,因为它让我们更好地了解、诊断和预防疾病,”英国肾脏研究中心的研究运营主任Elaine Davies总结道,她本人没有直接参与研究。(生物通 薄荷)

原文检索

Molecular insights into genome-wide association studies of chronic kidney disease-defining traits

Nature Communications volume 9, Article number: 4800 (2018)

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