广州医科大学,广州生物院联合发表Nature Methods等两篇文章

【字体: 时间:2018年04月03日 来源:生物通

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  广州医科大学-广州生物院联合生科院的Miguel A. Esteban教授团队研究成果分别在Nature Cell Biology 、Nature Methods连续发表。

  

广州医科大学-广州生物院联合生科院的Miguel A. Esteban教授团队研究成果分别在Nature Cell Biology 、Nature Methods连续发表。

其中,Miguel A. Esteban和南方科技大学助理教授Andrew P. Hutchins关于体细胞重编程的重要研究成果在Nature Cell Biology杂志在线发表,庄强、李文娟、Christina Benda为论文的共同第一作者。

在这篇文章中,研究人员发现共抑制因子复合物NCoR/SMRT-HDAC3可以与重编程因子c-MYC结合,并被其“引导”定位到基因组的特定位置。在这些基因组区域,NCoR/SMRT-HDAC3复合物的酶活性中心HDAC3会对基因组原本的组蛋白修饰进行调节,使基因组趋于更加闭合的状态,抑制基因的表达。由于被抑制的基因中包括了大量的多能性相关基因,因此从体细胞向多能性干细胞转换的过程会受到阻碍。

干扰NCoR/SMRT-HDAC3复合物,可以清除这些障碍,提高从体细胞向多能性干细胞转换的效率。此机制不仅与重编程有关,同时它们的功能异常也是多种癌症发生的关键因素。该研究中发现的机理也有可能适用于癌症的发生这一特殊的细胞命运转变过程。
 


NCoR/SMRT-HDAC3复合物在体细胞重编程中的作用机制

此外,Miguel A. Esteban教授与张必良研究员、鲍习琛副研究员团队的研究成果“Capturing the Interactome of Newly Transcribed RNA”,以广州医科大学为第一合作单位于Nature Methods在线发表,该研究利用自主研发的新技术RICK (newly transcribed RNA interactome using click chemistry),首次成功分离出结合非polyA RNA的结合蛋白,为该领域的研究增添了新的篇章。

研究团队利用核酸标记,巧妙地通过点击化学反应将新合成的RNA连接生物素,经过链霉亲和素偶联磁珠的分离,得到相应被标记 RNA分子和与其相结合的蛋白分子。应用该技术,研究者捕获了包括非polyA RNA在内的新生转录本RNA及其结合蛋白谱,同时发现细胞分裂调控因子作为新的RNA结合蛋白有结合非polyA RNA的潜能。

另外,通过对新生RNA结合蛋白组的分析,研究团队还发现调控代谢的相关酶类有结合新生RNA的能力,暗示着它们可能与RNA的转录或者剪接加工等过程存在一定的联系。


 
RICK技术流程图

原文标题:

Capturing the Interactome of Newly Transcribed RNA



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