为探索和验证lncRNA,Bio-Rad推出完整方案[新品推荐]

【字体: 时间:2018年04月04日 来源:生物通

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  Bio-Rad公司近日推出了IncRNA检测流程,这是一种RT-qPCR的流程,专门针对lncRNA的定量进行优化,可带来高度灵敏且特异的定量结果,适用于lncRNA的探索和验证。

长链非编码RNA(lncRNA)虽然不编码蛋白质,但在多个层面上调控基因的表达水平,包括表观遗传调控、转录调控和转录后调控。因此,lncRNA如今也成为一个研究热点。

不过,lncRNA的定量特别困难,因为它在某些发育阶段或某些细胞类型中的表达水平很低。同时,lncRNA的引物设计又是一件费时费力的事,因为这些目标往往位于复杂的基因组位点,并形成二级结构。

为此,Bio-Rad公司近日推出了IncRNA检测流程,这是一种RT-qPCR的流程,专门针对lncRNA的定量进行优化,可带来高度灵敏且特异的定量结果,适用于lncRNA的探索和验证。

Bio-Rad的lncRNA检测流程提供了从实验样品到lncRNA数据分析所需的所有工具,包括PrimePCR lncRNA Assay、预设计的PrimePCR lncRNA Array、定制的PrimePCR lncRNA Array以及新颖的iScript Explore One-Step RT and PreAmp Kit。它有望解决lncRNA研究过程中最迫切的挑战。

利用iScript Explore One-Step RT and PreAmp Kit,研究人员可以预扩增低丰度的lncRNA。对于材料有限的样本来说,这是扩增目标的关键步骤。 单靠这一个试剂盒,研究人员就能够进行基因组DNA消化、逆转录和预扩增。 通过专有的反应助推技术,即使是困难的目标也可以很容易地检测到。

利用RNA-Seq来发现lncRNA的确很强大,但未免太过昂贵和耗时。Bio-Rad的20种预先设计的PrimePCR lncRNA Array覆盖lncRNA研究的最活跃领域,包括癌症、免疫学和干细胞研究等。预先设计的芯片经过专业审校,包括经常引用的lncRNA以及通过生物信息学分析发现的新颖lncRNA,以帮助您发现目标。

这种芯片可与Bio-Rad新推出的Preblended lncRNA PreAmp Assay Pools结合使用,后者包含了在相应的预设计芯片上预扩增目标所需的所有检测,从而大大减少了手动设置时间。

对于那些已经确定了研究目标或者希望通过更多的样品来验证发现工作的研究人员,Bio-Rad的lncRNA检测流程也提供了解决方案。定制的PrimePCR lncRNA Array可以在每块芯片上设计10到384个lncRNA和mRNA目标。 如果需要,研究人员还可以在定制芯片中加入自行设计的单个检测。

在数据分析方面,Bio-Rad也提供了强大的lncRNA表达分析软件。CFX Maestro™软件能够简化设计、数据采集和分析。PrimePCR分析软件则允许非CFX实时定量PCR仪的用户分析PrimePCR数据。(生物通 余亮)

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