单细胞RNA测序定义人类乳腺3种上皮细胞

　　

加州大学欧文医学院的研究人员与加州大学旧金山研究所和西北大学的科学家合作，解剖人类乳腺上皮细胞，鉴定出了三种上皮细胞群，这些新细胞的发现有助于重新定义乳腺癌起源，改善早期癌症检测、减缓癌症进展，甚至可能预防癌症。

文章发表在《Nature Communications》，由加州大学欧文分校（UCI）生物化学助理教授、生物医学研究员Kai Kessenbrock博士领导，题目为“Profiling human breast epithelial cells using single cell RNA sequencing identifies cell diversity”。

研究人员利用下一代测序技术结合单细胞mRNA测序（scRNAseq）创建了一个高分辨率的人类乳腺上皮细胞分子普查。单细胞RNAseq技术使人们看到了以往都不曾发现的细胞差异。详细了解锐博生物的RNA-Seq技术服务>>

乳腺癌由乳腺上皮细胞遗传变异导致，遗传变化令乳腺组织细胞癌变，了解乳腺癌的早期起源，有潜力转化为癌症早期诊断方法，在疾病威胁生命之前构筑预防癌症第一道防线。

“我们对人体细胞多样性全谱还处于一知半解，特别是认识不同人类乳腺上皮细胞类型的知识盲点阻碍了我们研究不同细胞对癌症发生和发展的作用。我们新发现的三种上皮细胞类群填补了一部分知识漏洞，它将帮助我们了解乳腺癌系统的发展，”Kessenbrock说。

乳腺上皮包括两大类细胞：位于内层的分泌性管腔细胞（secretory luminal cells）和位于外层的基底/肌上皮细胞（basal/myoepithelial cells）。UCI的研究人员分析了七名个体（共计25,790个细胞）的单细胞基因指纹，无偏聚类分析鉴定出了三种不同的上皮细胞群：1种基底细胞和2种管腔细胞，管腔细胞可被区分为L1型和L2型，L1型是分泌细胞，L2型在乳腺组织内扮演激素敏感元件功能。

这些不同的乳腺上皮细胞亚群可作为重建不同亚型乳腺癌起源的起点。

“如今的技术为我们了解正常人类乳腺上皮细胞中存在的多种细胞群体提供了前所未有的洞察力，这些信息将转化成有价值的资源帮助我们了解乳腺癌早期阶段和疾病发展过程中的系统变化，”Kessenbrock说。

Kessenbrock实验室与UCI研究员Devon Lawson博士和MD安德森的Nicholas Navin博士正在用类似方法全面地绘图人体组织所有细胞类型，他们的研究隶属于国际性的由Chan/Zuckerberg倡议资助的人类细胞地图（Human Cell Atlas）项目的一部分。

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原文检索：Profiling human breast epithelial cells using single cell RNA sequencing identifies cell diversity

（生物通：伍松）