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从DNA片段化到文库构建真正单管一体化——Covaris oneTUBE!

【字体: www.ebiotrade.com 时间:2018年07月05日 来源:基因有限公司

摘要:

  在NGS二代测序文库构建中,通常使用超声片段化DNA处理后,还需将样本逐一吸出、转移后再进行下游建库反应,这一定程度上限制了超声打断法在二代测序全自动化解决方案上的应用。为了解决这一问题,Covaris 新推出了升级耗材——oneTUBE系列!

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在NGS二代测序文库构建中,通常使用超声片段化DNA处理后,还需将样本逐一吸出、转移后再进行下游建库反应,这一定程度上限制了超声打断法在二代测序全自动化解决方案上的应用。现在为了解决这一问题,Covaris 新推出了升级耗材——oneTUBE系列!

oneTUBE系列是由特殊聚合物材质合成耗材,用于实现NGS 打断建库一体化流程,在完成DNA片段化后,末端修复、接头连接以及PCR反应均可在oneTUBE一管中进行,整个文库构建过程中无需再进行样本转移, 避免了移液换液过程中的损失和污染。oneTUBE的管壁经过低吸附处理,最少可以进行10μl样本(或pg级样本)的处理,特别适合微量样本的自动化建库处理,为客户们解决文库起始量低的困难。

oneTUBE有8联排和96孔板两种形式,其中8联排8 oneTUBE-10 AFA Strip适用于ME220和LE220-plus,96孔板96 oneTUBE-10 AFA Plate适用于LE220-plus。

   
 
8 oneTUBE-10 AFA Strip              96 oneTUBE-10 AFA plate

oneTUBE系列耗材具有以下特点:

1.便于样本追踪管理:支持条码扫描和LIMS数据自动采集;
2.自动化整合,简化工作流程:与其他实验仪器适配,流程化高通量工作
3.消除实验转移步骤,管壁低吸附处理,提高样本回收率;
4.使用AFA专利技术,获得精准、可重复结果;
5.DNA打断体积从10ul到50ul,浓度可达100ng/μl;
6.支持加盖和贴箔封口;
7.下游容量可达200ul,适用于各种建库体系。

oneTUBE系列性能如何呢?看下面:

   

*8个样本使用oneTUBE-10 8连管在ME220上获得的实际平均片段大小与期望目标大小175bp和350bp的比较。数据于10ul工作体系中获得。

以上结果可见oneTUBE打断显示出非常好的准确性和高重复性,片段分布高度重合。

*使用96 oneTUBE-10 AFA Plate在LE220-plus上进行DNA剪切所得到的片段分布,设定的DNA剪切目的大小为300bp。图A:DNA总量1~50ng,图B:DNA总量100ng~1μg,图C:对不同浓度的DNA进行6次剪切重复实验,得到片段的平均大小。

如上图所示,在oneTUBE中,即使是不同浓度的DNA, 使用LE220-plus执行相同的片段化程序,依然可以得到高重复性的结果,无论是组内差异(相同浓度样本重复性)还是组间差异(不同浓度样本之间均值差异)均在很小范围内。

Covaris LE220-plus/ME220搭配oneTUBE,整个建库流程一次搞定,实现高通量自动化文库构建,节省耗材、减少样本损失,重复性、建库效率无需担忧!

oneTUBE耗材信息:

oneTUBE适配仪器信息:

ME220

通量:1-8
应用:DNA/RNA 剪切,ChIP剪切,Biomarker提取;
样本体积:15μl-1ml
功率:75 W PIP
温度控制:内置温控系统,温度范围7℃~20℃
 
LE220-plus

通量:1-1536
应用:DNA/RNA 剪切,ChIP剪切,Biomarker提取,药物合成与微粉化
样本体积:15μl-1ml
功率:2.5-500W
温度控制:内置温控系统,温度范围4℃~37℃
自动化整合:高度自动化

 
基因有限公司作为Covaris公司中国区独家代理商,为您提供最完整的DNA 片段化解决方案,也可为您提供ChIP实验,FFPE样本核酸提取解决方案等。基因有限公司的宗旨是“专才为专家服务”,有专业团队为各大科研机构提供安装培训,技术支持,应用培训与售后维护一条龙服务,赢得客户的一致好评与信任。想要了解更多,请关注我们的官方微信“基因快讯”或联系您身边的基因有限公司员工。


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