心脏病/糖尿病的风险高不高?多基因评分告诉你

【字体: 时间:2018年08月15日 来源:生物通

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  麻省总医院、Broad研究院和哈佛医学院的研究人员近日设计出全基因组多基因评分(GPS),以找出几种常见病风险增高的个体,包括心血管疾病、糖尿病和乳腺癌等。这项成果于本周发表在《Nature Genetics》上。

  

麻省总医院、Broad研究院和哈佛医学院的研究人员近日设计出全基因组多基因评分(GPS),以找出几种常见病风险增高的个体,包括心血管疾病、糖尿病和乳腺癌等。这项成果于本周发表在《Nature Genetics》上。

这篇文章的通讯作者、麻省总医院的基因组医学中心主任Sekar Kathiresan表示:“我们将多基因风险评分设想为确定高风险或低风险人群的一种方式,也许在出生时就可以使用,然后利用这些信息来制定干预措施,以便预防疾病。”

研究人员利用在欧洲个体上开展的几项大型全基因组关联研究的总结统计数据,设计出多基因风险评分(GPS),以此区分常见病风险高于常人三倍或以上的个体,包括冠心病、心房颤动、2型糖尿病、炎症性肠病和乳腺癌。之后,他们又利用英国生物样本库的数据验证了这些风险评分。

据Kathiresan介绍,研究人员最初想确定是否能够建立心脏病的GPS,因为他们研究这种病的遗传基础已经有十多年。通过三步策略,他们利用几种不同的算法将GWAS文件中的结果转换为冠心病及其他疾病的多基因风险评分。最终他们确定了一种算法。

随后,研究人员利用12万名英国生物样本库项目参与者的SNP数据,对这些候选的风险评分进行检测,之后他们又在一组独立的28万名参与者中进行检测。

按照家族性高胆固醇血症的突变风险模型,研究人员根据多基因风险评分评估了疾病风险至少是常人三倍的个体比例。以冠心病为例,这种疾病覆盖了660万个常见SNP。研究人员注意到8%的人群有着疾病风险达三倍甚至更高的SNP图谱。

Kathiresan指出:“根据这项新的多基因检测,加拿大或美国存在风险的患者人数达数百万。不过,这些人目前并没有意识到他们的风险,因为胆固醇和血压没有升高,其他的心脏病风险因素也没有出现。”

研究人员报告称,超过6%的人在心房颤动上的风险高于常人三倍或以上,而3.5%的人存在2型糖尿病的风险。另外,超过3%的个体存在炎症性肠病的风险,而乳腺癌风险明显偏高的个体也占到1.5%。

Kathiresan认为,这些信息对于疾病筛查和预防可能很重要。例如,他们团队之前的研究表明,通过改变生活方式,或使用他汀类药物,可减轻冠心病的遗传风险。不过,这项研究主要是针对欧洲血统的个体,其他种族的多基因评分还有待开发。

根据目前获得的结果,研究团队正在考虑与一些机构合作,希望不久后将多基因评分检测商业化。在接下来的六个月左右,它计划建立一个网络服务,让个体上传现有的基因分型数据,它来提供风险评分和解释信息。(生物通 薄荷)

原文检索

Genome-wide polygenic scores for common diseases identify individuals with risk equivalent to monogenic mutations

Nature Genetics  https://doi.org/10.1038/s41588-018-0183-z

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