Science:高引用癌症生物学重现论文从50篇减至18篇

【字体: 时间:2018年08月03日 来源:生物通

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  生物学研究重复性的问题一直都是科学家们无法逃避的问题,癌症生物学重现性计划(Reproducibility Project: Cancer Biology)由此而生,这一计划开始于5年前,目的是重现50篇高引用癌症生物学论文,但最新的消息传来,这一计划的重现癌症研究项目已经由50个减少到18个。

  

生物通报道:生物学研究重复性的问题一直都是科学家们无法逃避的问题,癌症生物学重现性计划(Reproducibility Project: Cancer Biology)由此而生,这一计划开始于5年前,目的是重现50篇高引用癌症生物学论文,但最新的消息传来,这一计划的重现癌症研究项目已经由50个减少到18个。

这一计划于2013年由开放科学与科学交流中心( Center for Open Science and Science Exchange,生物通注)发起。其初衷是复制2010年至2012年期间发表的50篇高引用癌症论文。然而,从2015年开始,由于预算和资源的限制,组织者开始减少论文数量。

“我希望我们能做得更多,”生物学家Tim Errington(弗吉尼亚州开放科学中心的项目负责人)说,“但是只有真正开始着手这一计划,我们才指导到底这有多困难。”

目前,复制实验的障碍包括缺乏详细的方案和难以获取试剂。 “我们希望能提高交流和分享”,Science Exchange总裁Elizabeth Iorns说。

迄今为止,他们已经在eLife中发表了18项复制研究中的10项,其中两项研究未能复制,两项尚无定论。而剩余的六项,研究人员能重现至少其中的一部分内容。

Science杂志指出,这一计划的50篇论文中的许多论文发现已经得到了其它独立研究团队的证实。目前他们将停止11项正在进行的重现工作。

可重复的研究

Sirota, M. et al. Sci. Transl. Med. 3, 96ra77 (2011)
这项研究证明了溃疡药物可减慢肿瘤的生长。它能够被重复,但统计分析有些不一致。

Delmore, J. E. et al. Cell 146, 904–917 (2011)
这项研究发现阻断蛋白序列可以抑制癌基因。它也能够被重复,但对照组的生物发光/存活存在明显不同。

无法解释的研究

Willingham, S. B. et al. Proc. Natl Acad. Sci. USA 109, 6662–6667 (2012)
这项研究发现,阻断CD47与另一个蛋白之间的接触可抑制肿瘤。验证工作主要针对处理肿瘤的生长和转移,但发现结果无法解释,因为一些肿瘤存在自发抑制。

Berger, M. F. et al. Nature 485, 502–506 (2012)
这项研究通过测序发现了黑色素瘤中频繁突变的基因。然而,验证工作却发现,没有突变的肿瘤也生长得很快,难以支持文章的结论。

无法重复的研究

Sugahara, K. N. et al. Science 328, 1031–1035 (2010)
这项研究发现一种肽段能帮助化疗药物渗透到肿瘤细胞中,从而增强其作用。不过,验证工作却发现这种肽段在小鼠身上并没有此作用。

具体可检索:https://elifesciences.org/collections/9b1e83d1/reproducibility-project-cancer-biology

原文标题:

Plan to replicate 50 high-impact cancer papers shrinks to just 18


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