Nature Methods：一种代谢研究新工具

患者希望能看到他们的医疗信息；研究人员希望能分享他们的数据。

　　

生物通报道：Scripps研究所的研究人员发布了一项新技术，将有助于检测合成或者天然代谢物，代谢物对于我们人体至关重要，因为它们与人的生理学的每个层面：基因组，转录组和蛋白质组都相互作用，可以说代谢物是生理学的主要操纵者，反映了个体的健康特征。

这一研究成果公布在Nature Methods杂志上。

“这真的是数据共享和加速发现过程，”Scripps研究所教授Gary Siuzdak博士说，这项研究由Siuzdak博士领导完成。他们开发的XCMS-MRM和METLIN-MRM是一种基于云的分析平台，帮助科学家能够量化生物样本中的分子。

世界上成千上万的实验室都在利用质谱法生成数据，因此这一平台在医学之外也是有用的，研究第一作者Xavier Domingo-Almenara博士和J. Rafael Montenegro-Burke博士说。

任何使用质谱的领域都可以从这些新资源中受益，例如环境科学，药物，法医学，食品控制和运动医学。

Siuzdak及其同事长期以来一直致力于让他们的研究工具免费向公众开放。研究的共同作者Paul Benton解释说，这一平台允许任何人，包括从合作者到患者，检查质谱结果的有效性。 “在一个不断质疑科学成果的时代，开放数据已成为发现过程的重要组成部分”。

近年来，开放数据共享的想法已经流行起来。自2004年推出以来，XCMS/METLIN平台已经发展到超过25,000名用户，其数据库中的分子在去年已从14,000增加到150,000。

新资源利用突破，通过识别分子的关键片段，让科学家加速研究，并提高精确度。

“除此之外别无他法，”Siuzdak说。

（生物通）

1.Xavier Domingo-Almenara, J. Rafael Montenegro-Burke, Julijana Ivanisevic, Aurelien Thomas, Jonathan Sidibé, Tony Teav, Carlos Guijas, Aries E. Aisporna, Duane Rinehart, Linh Hoang, Anders Nordström, María Gómez-Romero, Luke Whiley, Matthew R. Lewis, Jeremy K. Nicholson, H. Paul Benton, Gary Siuzdak. XCMS-MRM and METLIN-MRM: a cloud library and public resource for targeted analysis of small molecules. Nature Methods, 2018; 15 (9): 681 DOI: 10.1038/s41592-018-0110-3