10x Genomics计划推出ATAC-seq产品

　　

生物通报道  测序公司10x Genomics近日宣布收购表观遗传学初创公司Epinomics。据介绍，此次收购将为10x Genomics带来ATAC-seq技术和相关知识产权，从而加速表观基因组学研究，为深入了解疾病的诊断和治疗铺平道路。

ATAC-seq（染色质开放性测序技术）是一种利用转座酶来研究全基因组范围内染色质开放性的方法，于2013年10月在《Nature Methods》杂志上首次发表。它仅需少量细胞，通过简单的两步法操作即可捕获染色质的开放区域，适用于转录因子结合分析、核小体定位、活性调控元件分布等研究。

10x Genomics的CEO Serge Saxonov解释说：“它为评估染色质开放区域带来了一种相当直观的方法。基因组是所有可能事物的集合；开放染色质定义了细胞实际上干了什么。在我看来，ATAC-seq准确地获得了：哪些区域是开放的，哪些区域是关闭的。”

这篇论文的三位作者 – 斯坦福大学医学院的教授Howard Chang、助理教授Will Greenleaf，以及Paul Giresi是开发ATAC-seq技术的主要贡献者。2013年，他们联合斯坦福商学院的MBA Fergus Chan创立了Epinomics公司。

Epinomics的专利组合包括与ATAC-seq相关的知识产权。10x Genomics公司表示，Epinomics的知识产权与它现有的专利组合互补。同时，Chan、Giresi以及Epinomics团队将立即加入10x Genomics，而Chang和Greenleaf将担任10x Genomics的科学顾问。

Saxonov认为ATAC-seq有着广泛的应用前景，并与10x Genomics的单细胞基因表达产品互补。他认为，这项技术将应用在各个领域，最早是肿瘤学和免疫肿瘤学。

Epinomics一直在发掘这项技术的临床应用，包括利用表观基因组的特征来预测对免疫疗法的反应。同时，它也与斯坦福大学的Parker癌症免疫治疗研究所合作，利用生物标志物和表观基因组学技术来改善癌症免疫疗法。

10x Genomics正着手将Epinomics的表观遗传学技术与其自身的Chromium Single Cell ATAC Solution相整合，预计在今年年底前推出。

Saxonov表示，内测用户非常满意。“随着时间的推移，我们将分享更多数据，”他承诺。“这些数据看起来很棒；科学非常有趣。”

Epinomics是10x Genomics的第一个收购对象，但Saxonov承诺会有更多。“我们的目标是建立一家大规模的公司。作为一种手段，如果我们遇到了伟大的技术、伟大的公司、伟大的团队，那我们将考虑收购，”他说。（生物通 薄荷）

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• 了解到如何利用Chromium Single Cell ATAC方案，以单细胞分辨率绘制表观遗传全景图。
• 了解到斯坦福大学人体动态调节物组中心的主任Howard Chang教授（ATAC-Seq技术的共同发明人）如何利用Chromium Single Cell ATAC方案作为一种简便灵敏的方法来绘制基因调控图谱。

 

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