BabySeq发现常规新生儿筛查的不足之处

　　

生物通报道：2014年，美国布莱根妇女医院和波士顿儿童医院提交了新生儿测序项目（BabySeq Project.），希望能为一些父母健康的患病婴儿提供基因测序帮助。

近日，在1月3日的The American Journal of Human Genetics杂志上，一组研究人员宣布看BabySeq计划的最新进展——通过完成127名健康新生儿和32名患病新生儿的外显子序列测序，发现了15名婴儿的基因组变异，这会导致他们儿童期患上疾病的风险，而且其中140人都携带一种传统筛查无法检测到的疾病风险。

这指出新生儿常规筛查会漏掉一些疾病风险，“根据我们对婴儿的研究——无论是临床特征还是其家族病史，这些研究结果均未得到预期目标，”文章作者，纪念斯隆-凯特琳癌症中心的临床分子遗传学家Ozge Cehan-Birsoy说。

大多数新生儿都要接受听力筛查和血液检查，检测看看是否患上某些疾病，这些疾病如果不及时治疗就会致命，如囊性纤维化和苯丙酮尿症。

波士顿儿童医院的儿科医生Alan Beggs，贝勒医学院的生物伦理学家Amy McGuire和布里格姆妇女医院的遗传学家Robert Green之所以倡导BabySeq项目，部分原因是因为他们认为基因组测序可以深入了解为什么新生儿会生病。不过他们的主要研究问题是，“基因组信息如何影响婴儿”。

BabySeq是随机对照试验，研究中的所有268个家庭都会见了遗传咨询师，讨论他们的家族病史。超过一半的婴儿进行了整个外显子组测序，并且任何变异都通过Sanger测序验证，然后，Cehan-Birsoy等人审查了测序信息并编写了一份临床报告，这份报告送回了婴儿家庭，并录到医疗记录中，提供给他们的儿科医生。

在这次试验的测序组159名婴儿中，Beggs等人发现了15名婴儿患有与儿童期发生疾病相关的变异，这些变异与多种疾病有关，包括几种心脏病，代谢维生素生物素的酶缺乏和听力丧失。

“我们发现大多数这些变化与他们目前所患的疾病无关，”Beggs说，“问题是，这对他们有何影响？这种遗传信息可能具有一定的预测价值，但它并不是确定的，所有这些孩子很可能在可预见的未来不会疾病，“他补充道。

“当我们检测这些健康，且没有任何家族史的婴儿时，我们不知道基因中发现的变异是否真的会最终导致疾病，”儿科医生和遗传学家Cynthia Powell说， “希望他们能够长期关注这些孩子，看看他们是否确实发现了这些疾病的证据。不过这项研究确实提供了相当有力的证据证明（基因组测序）可能有所帮助。”

虽然测序能提供更多信息的，但在全面实施之前还有需要因素要考虑。Cehan-Birsoy估计，临床外显子组测序可能需要花费数千美元。而新生儿筛查最多花费几百美元，外显子组测序是否会为婴儿带来更好的预测效果还有待观察。

（生物通）

原文标题：

O. Ceyhan-Birsoy et al., “Interpretation of genomic sequencing results in healthy and ill newborns: results from the BabySeq Project,” The American Journal of Human Genetics,