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便携纳米孔测序仪可在田间快速准确地诊断未知小麦病毒
【字体: 大 中 小 】 时间:2019年10月23日 来源:生物通
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未雨绸缪地开发能够在现场快速诊断未知、或者已知作物/动物病情的技术方法,及早普及其应用和常规化,对于中国这样人口众多的国家是非常有重要和有战略意义的。过往的SARS,如今蔓延全国的非洲猪瘟,教训如此深刻,但愿我们的科学家能尽早开发出我们自己的检测新技术。
主要农作物、养殖业的异常病情往往需要及时处理应对,否则可能会导致严重的经济损失。
一种来自南美入侵的小麦真菌在孟加拉造成了小麦作物重大损失。这种麦瘟病在2016年首次发生,这一次小麦疾病蔓延估计有15000公顷(约占其全国小麦种植面积的16%),导致产量损失高达100%。
作物疾病的诊断是至关重要的,但是传统的方法依赖于植物病理学家,植物病理学家又依赖于植物外表的症状判断,而这些外部症状也有可能由其他因素造成——如营养不良或环境元素。有时候,就算是植物病理学家也难于检测出那些不影响地表以上部分的合并感染和病原体感染。
此外,在未知病原体爆发初期期间,原有的方法无法快速识别未知病原体,这在孟加拉国小麦真菌疫情爆发期间表现明显。
在堪萨斯州的一组科学家已经开发出一种新技术,可以在麦田现场以显著更高的精度、快速识别病毒。他们从堪萨斯西部收集了四个小麦样本并使用了一种新的、类似口琴大小的DNA测序仪和计算机程序,能够快速检测样品中的三种不同的病毒。此外,他们的研究结果表明,样品中含有一种新的病毒株。
USDA-ARS和堪萨斯州立大学的这些科学家,现在正在致力于改善技术以便更好地在田间现场使用。他们的研究,描述了在“Wheat Virus Identification Within Infected Tissue Using Nanopore Sequencing Technology”发表在9月的 Plant Disease上。这些结果将有望广泛应用于植物和动物疾病的识别和诊断技术领域。
这个研究给我们一个重要提示,未雨绸缪地开发能够在现场快速诊断未知、或者已知作物/动物病情的技术方法,及早普及其应用和常规化,对于中国这样人口众多的国家是非常有重要和有意义的。过往的SARS,如今蔓延全国的非洲猪瘟,教训是深刻的,但愿我们的科学家能尽早开发出我们自己的检测新技术。