NEB发布基因分型新品,满足植物育种需求

【字体: 时间:2019年10月30日 来源:生物通

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  一直以来,植物育种人员都在追求低成本、高通量的基因分型方法。为此,NEB公司近日推出了NEBNext直接基因分型解决方案(NEBNext Direct Genotyping Solution),可广泛应用在农业生物技术(AgBio)中。

一直以来,植物育种人员都在追求低成本、高通量的基因分型方法。为此,NEB公司近日推出了NEBNext直接基因分型解决方案(NEBNext Direct Genotyping Solution),可广泛应用在农业生物技术(AgBio)中。

NEBNext直接基因分型解决方案是基于杂交捕获的富集方案。与新一代测序(NGS)相结合,自动化的基因分型流程可以在一天内完成。它能够对100个至5,000个标记进行基因分型。多达96个样品的混合分析不仅降低了成本,也简化了流程。利用这个解决方案在Illumina单次测序运行中即可获得380万个基因型。

据介绍,这个基因分型解决方案是基于NEBNext Direct杂交捕获的靶向富集技术。它采用高效的捕获探针设计,可提供测序仪效率,并减少试剂用量,从而进一步降低了实验成本。

巴西农业研究机构Embrapa Bean and Rice的分子育种专家Tereza Borba博士表示:“我们有机会测试NEBNext直接基因分型解决方案,以评估它在水稻分子标记辅助育种中的可行性。这项技术带来了出色的数据,而NEB提供了出色的支持和跟进。”

荷兰安莎种子公司(Enza Zaden)的资深分子生物学研究人员Richard Feron则表示:“在日常工作中,我们需要一种技术,能够在稳定性、数据质量、多重水平、灵活性和通量方面脱颖而出。NEBNext直接基因分型解决方案满足了我们的这些要求。”

除了在农业生物学中的应用,这项技术还可以应用在其他一些需要低成本和高通量的领域。在一开始就加入条形码并混合样品,大大简化了实验流程,使其对人类和动物基因分型同样具有吸引力。NEB表示,这个方案也可以应用在生物样本库、NGS质控以及牲畜育种中。

NEBNext直接基因分型解决方案的特点包括:

▪ 对数百个至数千个标记进行基因分型的理想方案
▪ 通过预先混合96个样品来降低成本并简化流程
▪ 通过双条形码样品索引和分子标签(UMI)来提高测序仪的效率
▪ 基于杂交捕获的靶向富集带来无以伦比的覆盖均一性
▪ 精心设计的诱饵可避免标记信号丢失
▪ 一天的自动化流程可提高样品通量

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