环状RNA有望成为癌症生物标志物

【字体: 时间:2019年02月13日 来源:生物通

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  随着新技术的应用,研究人员有机会深入到基因组和外显子中,一种被称为环状RNA的RNA可能要“火”。

  

密歇根大学Rogel癌症中心的研究人员已经分类了多种癌症中的环状RNA,初步研究表明,这些稳定的结构可作为血液或尿液中的癌症生物标志物。

环状RNA是一种非编码RNA,它形成一个闭合的圆形结构,而不是普遍的线性结构。新RNA测序方法已经揭示了这一点,但其作用的原因和方式我们却知之甚少。这种稳定的结构使其成为发展癌症生物标志物的理想候选者。

这项发表在《Cell》杂志上的研究确定了癌症中环状RNA的概要,为将来应用创建了一个基础数据库。

“我对环状RNAs作为无创生物标记物的潜力感到兴奋,由于它们的稳定性,我们能够在癌症患者的血液或尿液中检测到它们,这可能对癌症诊断或预后有用,”密歇根中心转化病理学主任、密歇根医疗病理学教授Arul M. Chinnaiyan说。

研究人员鉴定了800多个肿瘤样本中的环状RNA,这些样本来自MiONCOSEQ项目的一部分。他们证明了为MiONCOSEQ开发的捕获RNA测序在检测环状RNA(circRNAs)方面比现有方法更为强大。

“过去的捕获方法基于探针,因此有局限性。捕获整个外显子的方法的意义则不可同日而语。我们用新方法捕获了大量RNAs。这就是为什么我们能一次性提名这么多不为人知的circRNAs的原因,”Chinnaiyan说。

该技术只需少量的总RNA,就能从中识别出circRNA,意味着即使RNA样本被(血液或尿液)稀释后也能方便地被检测到。

此外,研究小组还鉴定了前列腺癌组织中的几种circRNAs,并且它们比线状RNA更稳定,也可以从尿液中检出。

“我们证明了尿液中存在这些circRNAs,它们哪些是属于前列腺癌的。未来,我们将探索这些circRNAs作为尿液或血液为基础的癌症生物标志物的价值,”Chinnaiyan说。

这项研究已经转化为一个名为MiOncoCirc的数据库,根据肿瘤样本加以分类。该资源可供其他研究人员开发新的癌症生物标志物。

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原文检索:The Landscape of Circular RNA in Cancer

(生物通:伍松)

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