Pacific Biosciences推出新的Sequel II测序系统[新品推荐]

【字体: 时间:2019年04月25日 来源:PacBio

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  新的Sequel II测序系统非常适用于各种类型的变异检测,应用领域包括了大型基因组的从头组装,人类结构变异检测以及全长转录本分析等

Pacific Biosciences of California Inc.(纳斯达克股票代码:PACB)是基因组,转录组和表观基因组的高质量测序的领先供应商,于4月24号宣布Sequel®II系统的商业发布。该系统包括新的8M SMRT®Cell,以及配套试剂,仪器控制软件和SMRT Link软件包。与之前的Sequel系统相比,新的系统进一步降低了测序项目的成本和时间,其通量大约是之前的8倍。

PacBio已经开始向客户交付新的仪器,首批客户是参加Sequel II测序仪早期测试的5个客户,包括:Broad Institute, Wellcome Sanger Institute,HudsonAlpha Genome Sequencing Center,University of Maryland Institute for Genome Sciences和Icahn Institute for Data Science and Genomic Technology at Mount Sinai。所有5家早期试用客户在测试结束后都购买了Sequel II系统。

Sequel II系统基于先前Sequel系统的成熟技术和工作流程,但同时也升级了硬件以支持新的8M SMRT Cell。Sequel II系统可以提供高准确度的长读长Reads(HiFi Reads),同时还可以产出达到Sanger测序质量的Reads (精度>99.9% ), 通量大约是之前的8倍。

通过Sequel II系统,客户可以全面检测各种类型的人类基因组变异,从单核碱基突变到长片段复杂结构变异。同时Sequel II系统也是标准SMRT测序应用的理想选择,例如大型基因组的从头组装和使用Iso-Seq®方法的全长转录组分析。对Sequel II测序数据的分析表明,与Sequel系统相比,该系统可以提供相同或更高的测序精度。在仅有15倍人类基因组覆盖度的情况下,HiFi reads就可以实现全面的人类基因组变异检测。对于检测结构变异的精确度和敏感性能够达到≥95%,对于检测单碱基突变的精确度和敏感性可以达到≥99%,对于检测短的插入和缺失的精确度和敏感性可以达到≥96%。

早期试用客户还通过不同的测序应用对Sequel II系统进行了评估。来自HudsonAlpha Genome Sequencing Center的Jeremy Schmutz研究员评论说:“看到来自Sequel II系统的低成本人类基因组组装序列接近人类参考基因组的质量和完整性,这真是太神奇了,要知道人类参考基因组花费了数十亿美金和多年时间才达到现在的质量。我们已经将Sequel II系统用于人类基因组和复杂植物基因组的测序,结果与我们使用的Sequel系统一样好,但是Sequel II拥有更高的通量。

来自University of Maryland Institute for Genome Sciences的科学主任Luke Tallon说 “根据我们的经验,Sequel II系统基本上可以立即投入生产,我们已经将它用于一系列应用和样品类型的测序 - 从人类基因组到宏基因组和微生物组分析到非模型植物和动物基因组,结果都非常好。对于我们这种每年处理数万个微生物样本的实验室而言,Sequel II系统有可能实现真正深入且经济高效的微生物组和宏基因组测序。

Pacific Biosciences首席执行官Michael Hunkapiller博士说:“我们对早期试用测试的结果很满意,这证实了我们对Sequel II系统的内部评估是正确的。通过大幅提高产量,同时继续提供具有行业领先精度的长读长测序结果,Sequel II系统已经在推动科学向前发展,让科学家有机会解决长期以来难以解决的问题。在早期试用期间运行的第一个8M SMRT Cell是对一种植物基因组进行测序,其基因组组装连续性比目前公布的参考基因组高10倍。随着越来越多的科学家使用这一卓越的测序系统,我们期待看到更多有开创意义的测序结果。”

PacBio将于6月5日举办网络研讨会,其中包括Sequel II系统的概述以及几位早期试用客户的经验交流。 PacBio还将参加这些即将举行的会议,与会者可以了解更多有关Sequel II系统的信息:

•2019年人类基因组会议 -  4月24日至26日,韩国首尔(27/28号展位)
•PAG Asia 2019  -  6月6日至8日,中国深圳(25号展位)
•欧洲人类遗传学会议(ESHG)2019年6月15日至18日,瑞典哥德堡(560号展位)
•ASM Microbe 2019年6月20日至24日,加利福尼亚州旧金山(1160号展位)

有关更多信息,请访问:www.pacb.com/sequel

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