PromethION纳米孔测序仪产量突破7 Tb

Oxford Nanopore公司近日宣布，PromethION 48（P48）测序仪的通量已突破7 Tb。PromethION测序仪采用与MinION和GridION相同的架构，以模块化形式提供了实时、长读长且高通量的纳米孔测序数据。

此次实验同时运行了48张测序芯片，并实时进行碱基识别。凭借今年早期发布的软件的优势，PromethION Beta、P24和P48版测序仪的测序芯片可以在用户选择的情况下全部同时运行。

据介绍，P48在81小时内获得了7.3 Tb的数据量，它使用的测序芯片与当前交付给客户的芯片完全相同。它使用了一个准备在今年5月发布的新版运行脚本，该脚本可以进一步延长测序芯片的使用寿命。

研究人员在这些芯片上测序了两个样本：犹他州人基因组（NIST RM8398）和犹太德系人基因组（NIST RM8391），采用最新的Flip-flop软件运行碱基识别。本次实验是由工作人员在验证新设备时开展的，下一步他们将支持客户重复这些结果。

目前，Oxford Nanopore提供两个版本的PromethION测序仪，包括极高通量的P24版和超高通量的P48版。P24版可同时运行24张测序芯片，内部已经能获得3.6 Tb的数据量。P48版可同时运行48张测序芯片，近日已获得7.3 Tb的数据量。

Oxford Nanopore认为，PromethION测序仪适用于重点实验室或服务供应商。用户可利用它来开展动植物基因组测序或大规模群体研究，也可以随时开始或停止单个测序实验。

PromethION仪器本身不需要付费，研究人员可以选择购买不同大小的测序芯片套装，用户成本为$1700 - $625美元，后者使得人类基因组的商业化测序成本降到低于$1000美元。

Oxford Nanopore最早推出的是PromethION beta版测序仪。到2018年底，公司内部测试时每个流动槽可以产生220 Gb，而用户组的记录也超过了160 Gb。用户可选择继续使用PromethION beta版，也可以升级到新版本。（生物通 薄荷）