武汉大学最新Cell提出新概念：RNA结合蛋白作为转录因子调控转录

研究人员通过ChIP-seq（染色质免疫沉淀测序）技术大规模检测了63个有细胞核定位的RNA结合蛋白与染色质的相互作用，意外地发现约60%的RNA结合蛋白与染色质有广泛的相互作用，并且富集在基因启动子和增强子区域。

　　

RNA结合蛋白在转录后的剪接加工、修饰、转运、细胞定位、稳定性、翻译和降解等RNA代谢过程中发挥着重要的调控功能，但其在转录水平的调控功能和机制尚未有系统的研究。

来自武汉大学医学研究院，加州大学圣地亚哥分校的研究人员发表了题为“Pervasive Chromatin-RNA Binding Protein Interactions Enable RNA-based Regulation of Transcription”的文章，通过ChIP-seq（染色质免疫沉淀测序）技术大规模检测了63个有细胞核定位的RNA结合蛋白与染色质的相互作用，意外地发现约60%的RNA结合蛋白与染色质有广泛的相互作用，并且富集在基因启动子和增强子区域。

这一研究发现公布在6月27日的Cell杂志上，文章的通讯作者为武汉大学医学研究院、免疫与代谢前沿科学中心肖锐研究员（同为第一作者）与美国加州大学圣地亚哥分校（UCSD）付向东教授。

研究人员通过ChIP-seq（染色质免疫沉淀测序）技术大规模检测了63个有细胞核定位的RNA结合蛋白与染色质的相互作用，发现约60%的RNA结合蛋白与染色质有广泛的相互作用，并且富集在基因启动子和增强子区域。

更令人惊讶的是，该研究虽然只检测了人类基因组中一小部分的RNA结合蛋白（<5%），却发现约40%的活性染色质区域和约70%的活性启动子区域都存在RNA结合蛋白的特异性结合，这提示RNA结合蛋白在染色质水平存在着广泛的功能和作用。随后，通过GRO-seq（Global Nuclear Run-On测序）实验证实，部分RNA结合蛋白具有强烈的转录调控作用。

这项研究还重点阐释了RNA结合蛋白RBM25通过调控转录因子YY1与染色质的结合，进而调控染色质结构和转录激活与抑制的分子机制，全面展示了特异性的RNA结合蛋白介导的转录因子YY1的功能调控作用。整个发现提出了RNA结合蛋白作为转录因子或辅助因子调控转录的新概念，也开辟了RNA结合蛋白功能研究的新领域。

肖锐研究员是医学研究院2017年引进的优秀归国人才，本科和博士毕业于武汉大学生命科学学院，博士和博士后期间师从RNA研究领域专家UCSD的付向东教授，至今一直专注于自己热爱的RNA生物学和功能基因组学领域开展研究工作，并取得了一系列重要的成果。近年来，肖锐研究员作为第一作者和通讯作者在Cell（1篇），Nature（2篇）和Molecular Cell（2篇）等顶尖期刊上发表了多篇高水平研究论文。

原文标题：

Pervasive Chromatin-RNA Binding Protein Interactions Enable RNA-based Regulation of Transcription

https://doi.org/10.1016/j.cell.2019.06.001