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PacBio公司推出新的测序系统Sequel IIe

【字体: 时间:2020年10月12日 来源:生物通

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  在提高仪器内部的数据处理和计算能力后,新系统能够比以往更快速更经济地产生高度准确的长读长(HiFi reads),从而为科学家提供全面的基因组和转录组视图。

美国PacBio公司近日宣布推出Sequel IIe测序系统。新一代的仪器同样是基于PacBio成熟的单分子实时(SMRT)测序技术。不过,在提高仪器内部的数据处理和计算能力后,新系统能够比以往更快速更经济地产生高度准确的长读长(HiFi reads),从而为科学家提供全面的基因组和转录组视图。

Sequel II系统于2019年4月推出,其数据产量相对以往的系统大大提高,可明显降低项目成本和缩短项目周期。在《The Scientist》杂志评选出的2019年十大创新产品中,Sequel II测序系统位列其中。同时,它也被生物通读者评为2019生命科学十大创新产品。

基于Sequel II系统的高可靠性和出色性能,Sequel IIe系统在硬件和软件上有了改进,让用户能够直接获得PacBio HiFi reads。Sequel IIe针对HiFi测序进行了优化,减少了用户对测序数据进行后处理的需要,在总体上将二级分析时间减少了70%,具体时间要根据应用而异。

此外,它的新功能可将文件传输和数据存储需求减少多达90%。配套的SMRT Link 10软件包含功能强大的新分析工具(可在亚马逊云上实现完整的工作流程集成),以及新的Genome Assembly分析程序,可根据HiFi reads生成参考基因组质量的从头组装结果。

贝勒医学院人类基因组测序中心的助理教授Fritz Sedlazeck博士表示:“HiFi reads可实现单核苷酸变异和结构变异的同时检测,为人类遗传学的发展铺平道路,并极大地扩展了SMRT测序的实用性。直接在Sequel IIe系统上生成HiFi reads将有可能更加经济和高效地开展HiFi测序。”

PacBio HiFi reads结合了Sanger测序的准确性(> 99.9%)和长读长(长达25 kb)。HiFi reads的读长和准确性使其非常适合基因组的从头组装、SNV和SV检测以及其他基因组或转录组研究。HiFi reads为全球多个备受瞩目的研究项目提供了重要数据,包括Telomere-to-Telomere Consortium、Darwin Tree of Life等。

PacBio的首席执行官Christian Henry表示:“新的Sequel IIe系统代表了我们技术的又一个进步,让HiFi数据可用于任何需要高准确度和长读长的基因组或转录组项目。在有HiFi测序之前,研究人员需要使用多种技术和复杂的分析方法,才能获得与HiFi数据相当的结果。借助Sequel IIe系统,现在可以直接生成HiFi数据,而科学家只需使用一种测序技术就可以充满信心地获得测序结果。”

PacBio目前开始接受Sequel IIe系统的订单,预计将于本季度开始交付新仪器。此外,现有的Sequel II System的客户将能够购买仪器升级包,这将为他们提供Sequel IIe System的所有功能。

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