人源化HIV-1小鼠模型多组学研究揭示HIV-1在体内的真实面貌

【字体: 时间:2020年07月30日 来源:

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  为了根除HIV-1感染,阐明HIV-1感染细胞在体内的详细特征和异质性是非常重要的。本研究利用造血干细胞移植的,揭示了HIV-1产生细胞在体内的多重特性。

  

为了根除HIV-1感染,阐明HIV-1感染细胞在体内的详细特征和异质性是非常重要的。本研究利用造血干细胞移植的,揭示了HIV-1产生细胞在体内的多重特性。

东京大学医学科学研究所(IMSUT)的一个研究小组利用HIV-1感染的细胞进行了“多组分”分析,这是最近发展起来的全面研究生物样本特征的技术。

“我们描述了体内HIV-1细胞的多种特性,这可能为开发治疗HIV-1提供线索,”IMSUT传染病控制系系统病毒学部副教授(首席研究员)Kei Sato说。

这项研究的结果发表在2020年7月14日的Cell Reports上。

旨在“HIV-1治愈”的研究

深入了解HIV-1感染细胞在体内的广泛特性,对于根除HIV-1感染具有重要意义。

最近发展起来的“组学”分析可以成为确定HIV-1感染细胞特征的有力工具。然而,应该注意的是,受感染个体中的绝大多数CD4+T细胞是未受感染的,因此,体内“散装”CD4+T细胞的转录谱并不反映“纯”HIV-1生成细胞的转录谱。

多组分分析法全面揭示HIV-1感染细胞的体内特征

在这项研究中,研究小组使用了人类造血干细胞移植的人源化小鼠模型,在体内维持人类白细胞处于相对稳定的免疫条件下,并使用了四种最新开发的技术来研究病毒基因组学和转录组学。

据研究小组称,本研究包括以下四项分析:

首先,液滴数字PCR揭示了感染的人源化小鼠体内存在潜在的蓄毒池。第二,连接反应介导的PCR显示HIV-1更倾向于整合到开放的染色质区域,正如整合位点的表观遗传修饰与病毒产生的关联所示。第三,数字RNA测序定量分析了HIV-1产生细胞中病毒转录物的绝对拷贝数,并进一步确定了病毒感染和未感染细胞之间差异表达的基因。最后,单细胞RNA测序揭示并表征了体内HIV-1产生细胞的异质性。

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Sato副教授强调:“据我们所知,这项研究是首次对HIV-1产生细胞进行多方面描述的研究,也是首次对HIV-1感染细胞在体内的特性进行全面研究”。

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原文检索:Multiomics Investigation Revealing the Characteristics of HIV-1-Infected Cells In Vivo

(生物通:伍松)

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