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QIAGEN最新推出新冠病毒的建库和分析产品

【字体: 时间:2020年08月25日 来源:生物通

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  为了深入探索新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的进化和传播,QIAGEN公司近日推出了新的建库产品QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel,以及集成的分析和解释流程。

为了深入探索新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的进化和传播,QIAGEN公司近日推出了新的建库产品QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel,以及集成的分析和解释流程。

据介绍,QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel能够一天内完成文库制备,便于研究人员利用新一代测序来追踪病毒基因组的变化。整个过程分为两步,首先利用QIAseq技术进行逆转录和cDNA合成,然后生成与Illumina测序平台兼容的文库。与混合捕获的解决方案相比,这个流程更加快速,对起始量的要求也更低。

同时,基于CLC Genomics Workbench,QIAGEN还推出了为SARS-CoV-2基因组分析而量身定制的软件流程。研究人员可利用该流程来鉴定各个样本之间病毒基因组序列上的差异,并通过系统发育方法观察不同人群和地区的病毒株差异。

今年6月,印度国家生物医学研究所领导的研究团队在《Journal of Biosciences》杂志上发表了一项分析印度COVID-19流行病学的新成果,这是第一项利用新的QIAGEN流程开展的独立研究。

研究人员利用QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel对数量不多的样本进行病毒基因组扩增,将RNA转换成双链cDNA并进行扩增,然后生成可在Illumina平台上测序的文库。之后,他们利用QIAGEN的CLC Genomics Workbench进行组装和分析。

第一作者、印度国家生物医学研究所的副教授Arindam Maitra表示:“我们迫切需要对这种病毒的进化进行深入研究。正如我们在印度东部发现的那样,SARS-CoV-2基因组正发生突变,这些突变可能会调控病毒的传播、复制效率和毒力。与其他方法相比,QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel这样的病毒基因组扩增方法很适合研究低拷贝数的样本。”

此外,QIAGEN还提供了完整的QIAseq流程,有助于解读SARS-CoV-2病毒、宿主及其微生物群之间的复杂相互作用。早前发表的一项研究证明了QIAseq FastSelect rRNA去除技术能够促进SARS-CoV-2宏转录组学研究,从而更全面地评估COVID-19患者的共感染率。

自COVID-19疫情发生以来,QIAGEN就一直在努力打造最全面的产品组合。他们正在努力提高病毒RNA提取试剂盒的产量,以便用于QIAGEN的QIAcube、QIAsymphony和EZ1平台以及第三方仪器。他们还在QIAstat-Dx和NeuMoDx系统上建立了一系列PCR检测,可在检测新冠病毒的同时分析样本中是否存在其他呼吸道感染。(生物通 薄荷)

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