10x Genomics新品同时分析单细胞转录组和表观基因组

　　

10x Genomics公司近日宣布正式发售Chromium单细胞多组学ATAC + 基因表达解决方案，该产品能够同时对同一单细胞开展表观基因组和转录组分析。通过这种多组学方法，研究人员可以将细胞的表观遗传程序与转录图谱相关联，从而更好地了解细胞功能。

Chromium单细胞多组学ATAC + 基因表达解决方案带来了细胞的基因表达谱及其表观基因组景观的一体化视图。它同时采用两种模式，能够提高细胞状态的分辨率，鉴定差异基因表达的驱动因素，并发现转录图谱相似但染色质景观功能不同的细胞。

据介绍，这种多组学分析有助于了解肿瘤异质性的驱动因素、治疗耐药的机制以及与神经退行性或免疫性疾病相关的细胞类型。

这个新的解决方案是基于10x Genomics今年推出的一系列新产品，包括适用于单细胞分析的Chromium平台以及适用于空间基因组学的Visium平台。目前已有多名客户试用了Chromium单细胞多组学ATAC + 基因表达，包括斯坦福大学医学院、西奈山伊坎医学院和西班牙国家基因组分析中心。

斯坦福大学医学院的病理学助理教授Ansuman Satpathy博士表示：“我的实验室很想了解为什么有些免疫细胞无法对抗癌症。我们计划使用10x Genomics的新产品来了解免疫细胞功能缺陷的表观遗传和转录调控，并在将来利用此信息来设计更精准有效的免疫疗法。”

西班牙国家基因组分析中心的单细胞基因组学团队负责人Holger Heyn博士正在研究B细胞分化和激活的机制。他表示：“之前，我们一直依靠计算机预测将细胞的表观基因组与单细胞基因表达谱相匹配。10x Genomics的多组学分析让我们能够直接测定以往只能预测的内容，并且能够确认这些预测的准确性如何。”

西奈山伊坎医学院的遗传学和基因组学副教授Panagiotis Roussos博士谈到：“通过这项新技术，我们可以更好地了解各种神经精神疾病中的非编码遗传变异的作用机制，包括阿尔茨海默病、帕金森病、精神分裂症、双相情感障碍和重度抑郁症。”

有了Chromium单细胞多组学ATAC + 基因表达，研究人员能够：

▪ 通过转录和表观基因组的关联分析来加深其对细胞类型和状态的鉴定
▪ 发现转录图谱相似但染色质景观功能不同的细胞
▪ 探索细胞分化、发育和疾病背后的基因调控相互作用
▪ 使用关键的表达标志物来轻松解释表观遗传图谱
▪ 通过同一细胞的多个读数，从宝贵样本中获得最大量的信息

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