单细胞转录组分析揭示转移性胃腺癌的预后特征

　　

胃癌是全世界死亡率高居第三位的常见恶性肿瘤。多数人被诊断为胃癌时已是进展期，更容易发生转移和复发。无论是早期胃癌还是晚期胃癌，腹膜转移都是最常见的转移或复发方式。

由于缺乏有效的治疗手段，胃癌一旦发生腹膜转移，患者的中位生存时间不足6个月。为此，美国德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员近日对转移性胃腺癌开展了深入分析。他们绘制了多名胃腺癌患者的腹膜癌的单细胞转录组图谱。

这项成果于1月4日发表在《Nature Medicine》杂志上。共同通讯作者Jaffer Ajani称：“腹膜癌代表了临床上一种未满足的需求，因为我们无法为这些患者提供有效的治疗方案。根据这项研究，我们需要对每名患者的细胞进行分析，以便提供更多量身定制的治疗选项。”

Ajani及其同事对来自15名胃腺癌患者的45,048个腹膜癌细胞开展了转录组分析，以揭示肿瘤内异质性。通过细胞谱系和差异表达基因分析，他们总结出12个基因的预后表达特征，似乎与腹膜癌患者的生存结果一致。

研究人员随后利用了癌症基因组图谱（Cancer Genome Atlas）计划及其他三个大型的研究队列中1,336例胃腺癌病例的数据，验证了他们发现的预后特征。该特征将肿瘤分为“胃占优势”组和“胃肠道混合”组。

另一名共同通讯作者、MD安德森癌症中心的科学家Linghua Wang表示：“有趣的是，根据谱系组成对肿瘤细胞进行分类，我们注意到两组患者。胃样（腹膜癌）细胞越多，侵袭性越强，且患者的生存期越短。不过，肠样的（腹膜癌）细胞越多则侵袭性越弱，患者的生存期就越长。”

此外，研究人员还利用单细胞RNA-seq数据以及其他分子、基因型和表型线索来研究哪些细胞类型和谱系有助于腹膜癌的形成和特征。他们还探索了转移至腹膜间隙的胃腺癌肿瘤的瘤内异质性。

尽管之前的研究普遍认为，高水平的瘤内异质性往往代表了胃腺癌病例预后不良，但研究人员指出，单细胞转录组学方法能够更深入地探索预后的相关因素，从而实现进一步的研究。

“我们朝着更好地了解这些癌细胞的单细胞生物学迈出了重要的第一步，但我们还有更多工作要做，”Ajani谈道。“我们预计，未来某一天将能够利用这种异质性来指导临床决策，让每位患者获益。”（生物通 薄荷）

原文检索

Wang, R., Dang, M., Harada, K. et al. Single-cell dissection of intratumoral heterogeneity and lineage diversity in metastatic gastric adenocarcinoma. Nat Med (2021). https://doi.org/10.1038/s41591-020-1125-8