Nature发布糖尿病研究里程碑成果

【字体: 时间:2021年05月20日 来源:生物通

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  研究人员对1型糖尿病进行了迄今为止最大的GWAS,分析了520580个基因组样本,识别了69种新的关联信号。然后,他们在胰腺和外周血细胞类型中定位了448142个顺式调节元件(基因内或基因附近的非编码DNA序列)。

  

通过绘制糖尿病的基因基础,加州大学圣地亚哥分校(University of California San Diego School of Medicine)的研究人员确定了1型糖尿病中特定细胞类型的预测因果作用。

研究结果发表在2021年5月19日的Nature杂志网络版上。

1型糖尿病是一种复杂的自身免疫性疾病,其特征是产生胰岛素的胰腺β细胞受损和丧失,随后出现高血糖(高血糖),这对身体有害,并可能导致其他严重的健康问题,如心脏病和视力下降。1型糖尿病比2型糖尿病少见,但其流行率正在上升。目前,没有治愈方法,只有疾病管理。

1型糖尿病的发病机制,包括自身免疫如何被触发,目前尚不清楚。由于它有很强的遗传成分,近年来进行了大量的全基因组关联研究(GWAS),研究人员比较了患有相同疾病或条件的人的整个基因组,寻找可能与该疾病或条件有关的遗传密码的差异。

在1型糖尿病的案例中,确定的风险变异很大程度上是在基因组的非编码区域发现的。在最新研究中,加州大学圣地亚哥分校医学院儿科学助理教授Kyle Gaulton博士和他的同事们将GWAS数据与外周血和胰腺细胞类型的表观基因组图谱相结合。表观基因组图谱详细描述了细胞中基因是如何以及何时开启和关闭的,从而决定了对特定细胞功能至关重要的蛋白质的生产。

具体来说,研究人员对1型糖尿病进行了迄今为止最大的GWAS,分析了520580个基因组样本,识别了69种新的关联信号。然后,他们在胰腺和外周血细胞类型中定位了448142个顺式调节元件(基因内或基因附近的非编码DNA序列)。

Gaulton说:“通过结合这两种方法,我们能够识别疾病变异的细胞类型特异性功能,并发现胰腺外分泌细胞在1型糖尿病中的预测因果作用,我们能够通过实验验证。”

胰腺外分泌细胞产生的酶分泌到小肠中,帮助消化食物。

合著者Maike Sander医学博士表示这些发现代表了对1型糖尿病成因的认识上的一个重大飞跃。她把这项工作描述为“里程碑式的研究”。

这意味着外分泌细胞功能障碍可能是疾病的主要原因。这项研究提供了一个基因路线图,从中我们可以确定哪些外分泌基因可能在疾病发病机制中起作用。”

(生物通)

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