新的基因工具提高了拯救维多利亚州濒危州鸟的潜力

由莫纳什大学的科学家领导的一个团队完成了一个重要的里程碑，实现了对极度濒危的盔状食蜜兽的救援，它是澳大利亚维多利亚州的象征。科学家们已经破译了这种鸟的基因组，并创造了额外的高质量遗传信息，这为可能增加这些鸟的基因健康打开了另一种途径。这些新工具将使研究人员能够监测这种戴头盔的食蜜鸟与另一亚种繁殖的健康状况和影响。这种带盔的食蜜鸟也加入了一种非常小的鸟类，它们既有染色体长度的基因组，也有基因图谱。这项研究今天发表在开放科学杂志GigaScience上。

　　

   

   

图片:“海伦娜”，戴着头盔的蜜食动物(Lichenostomus melanops cassidix)，其基因组已被排序，位于澳大利亚维多利亚州的Yellingbo自然保护保护区。Nick Bradsworth拍摄。

由莫纳什大学的科学家领导的一个团队完成了一个重要的里程碑，实现了对极度濒危的盔状食蜜兽的救援，它是澳大利亚维多利亚州的象征。科学家们已经破译了这种鸟的基因组，并创造了额外的高质量遗传信息，这为可能增加这些鸟的基因健康打开了另一种途径。这些新工具将使研究人员能够监测这种戴头盔的食蜜鸟与另一亚种繁殖的健康状况和影响。这种带盔的食蜜鸟也加入了一种非常小的鸟类，它们既有染色体长度的基因组，也有基因图谱。这项研究发表在开放科学杂志《GigaScience》(doi.org/10.1093/gigascience/giac025)上。

自从非土著居民来到澳大利亚，200年来，带盔的蜜鴷的数量急剧下降。到20世纪80年代，仅存约50只，全部集中在黄陵波自然保护区内的一个地点。通过标准的保护措施，包括栖息地恢复和圈养繁殖计划，该种群的数量已经增加到大约250只。然而，这些活动不太可能足以确保这种戴着头盔的采蜜者的长期未来。一个主要的问题是，剩下的小种群主要由遗传变异水平低的亲缘鸟类组成。因此，近亲繁殖是普遍的，产生的后代往往死于年轻和繁殖不好。小的种群规模也常常导致有害突变的积累。因此，即使环境条件可以改善，这些遗传问题仍然会使种群由于繁殖无效和存活率低而容易灭绝，特别是在受到疾病爆发和其他挑战的影响时。

为了提高这种戴着头盔的食蜜兽的基因健康，一个由科学家、环境机构和社区团体组成的团队正在共同努力，通过引入这种濒危物种小基因库之外的一个亚种的基因，来创建一个“基因拯救”计划。

莫纳什大学研究小组成员亚历山德拉·帕夫洛娃博士解释道:

“因为这种盔状食蜜兽是最后一种，所以基因扩增肯定来自不同的亚种。然而，这种基因混合并不常见:保护管理者通常避免杂交亚种，因为担心失去当地的适应性和特殊性。”

这些问题现在可以避免了，因为第一个染色体长度基因组序列的可用性为盔状食蜜兽也就是说，数据的质量是如此之高，以至于基因“字母”组合的序列覆盖了整个染色体，而不是更常见的不完整和不连续性的基因组序列。此外，研究人员还制作了一个高密度基因图谱，其中包括5万多个标记位置。有了这么多标记的基因图谱，科学家们就可以精确地追踪到个体中每条染色体的哪一部分遗传自父母双方。新的基因组序列和遗传图谱将被用来指导目前戴着头盔的食蜜动物基因库之外的DNA“混合”的过程。总之，这些工具可以作为一种手段，告知育种决策正在进行的基因拯救努力，并允许这是非常精确地完成。

主要作者Diana Robledo-Ruiz解释道:

“基因组序列和遗传图谱将被用来在通过近亲繁殖拯救盔状食蜜兽从灭绝中获得正确的平衡，同时保留使其成为盔状食蜜兽的独特特征。”

现在有了这种特殊的基因组资源，拯救戴着头盔的食蜜动物开始了新的篇章。然而，如果没有成百上千人和许多组织的热情、承诺和工作，戴着头盔的食蜜者可能已经灭绝了。

Paul Sunnucks教授是这项研究的合著者，他提供了一些细节:

这项支持包括联邦和州政府机构，包括环境、土地、水和规划部(DELWP)和维多利亚动物园。一些人，如DELWP的Bruce Quin，已经为保护该物种付出了30年或更长时间的努力，而一个高效的社区组织，盔蜜兽之友，在30多年的时间里为保护计划提供了一系列的帮助。这是一个令人鼓舞的案例，人们关心并真正改变了生物多样性的结果。”