利用环境DNA来调查濒危物种的种群

对濒危物种的调查通常涉及大量的实地调查，需要时间和精力。大多数生活在河流流域的濒危物种由于缺乏栖息地数据而难以发现和研究。日本冈山大学的科学家们开发了一种新的基于eDNA分析的定量分析技术，以记录濒危的苦水鱼(Rhodeus atremius suigensis)的存在。

　　

   

   

图片:R. a。在日本的自然栖息地，绥靖是一种濒临灭绝的物种。冈山大学的科学家开发了一种新的环境DNA调查方法，可以帮助保护这个物种。    

资料来源:Kazuyoshi Nakata

河流系统的变化、过度捕捞和新入侵物种的出现可能导致栖息在水生生态系统中的本地鱼类数量急剧下降。在日本的芦田河流域，苦鱼(阿特remius suigensis)，过去曾大量繁殖，如今已濒临本地绝种。考虑到它被公认为淡水生态系统鱼类多样性保护的指示物种，这是令人担忧的。保护本地水生动物的工作需要对大面积进行实地研究，以了解不同物种的栖息地需求和种群密度。这是一项具有挑战性的任务，需要大量的时间和精力。为了克服这一障碍，科学家们通常专注于小范围的研究，并追踪生物体丢弃到环境中的DNA。这种环境DNA(或eDNA)可以被分析，以非侵入性和高效的方式识别最近访问该地区的物种。

最近，来自日本冈山大学的科学家们使用eDNA不仅调查了它们的存在，而且还调查了它们的分布和种群密度水草在日本福山的芦田河流域。他们采用半定量的eDNA分析方法，采用聚合酶链式反应(PCR)技术。他们开发了DNA引物，可以检测到一段线粒体DNA水草这使得他们的分析只针对这个特定的物种。 

”在进行实地调查之前，我们首先确认了这种分析在水族馆实验中的实用性。”冈山大学的Kazuyoshi Nakata教授说，”我们在芦田河流域的一个农业河道的48个点设置了渔网，并研究了鱼类存在与eDNA浓度之间的关系研究小组还包括冈山大学的Kanoko Otsuki女士，Mayuko Hamada博士，Tatsuya Sakamoto教授，以及国家农业和食品研究组织的Noriyuki Koizumi博士。 

研究人员发现，eDNA浓度根据下游通道距离样本的位置而变化水草距离越远，eDNA浓度越低。“我们的结果可以作为下游eDNA可以检测到多远和多少的参考，这将有助于指导未来的保护调查。”中田教授说。

因此，研究人员可以证实，eDNA的浓度指示的分布和丰度水草． 由于这项技术只需要在实地取样，即使是当地居民也可以帮助进行生态调查。未来的保护工作可以应用从这些调查中获得的信息来设计适当的策略。

这种技术是高度可扩展的，可以复制到更大的区域。此外，随着相应分子工具(如特异性引物)的开发，该技术也可以用于其他濒危物种的调查。这不仅有助于促进濒危物种的保护，而且还有助于在当地社区的参与下提高对生物多样性保护重要性的认识。

文章标题

Quantitative PCR method to detect an extremely endangered bitterling fish (Rhodeus atremius suigensis) using environmental DNA