盐肤木基因组揭示单宁与黄酮生物合成及腺毛发育的分子机制

本研究通过构建染色体级别的盐肤木（Rhus chinensis）基因组（357.62 Mb），系统解析了其环境适应性的遗传基础。研究发现防御相关基因（几丁质酶、黄酮合成基因）显著扩张，鉴定出单宁水解关键基因RcTA1及其转录激活因子RcDIV1。同时揭示RcGL2调控的多细胞腺毛结构与扩张的转运蛋白（ABCG）协同增强ABA响应，通过分泌酚酸/有机酸形成果表盐晶状覆盖物，驱动耐盐性。该基因组为药用成分生物合成及抗逆机制研究提供了重要遗传资源。

　　

基因组特征与进化分析

研究通过整合Illumina、PacBio和牛津纳米孔测序数据，结合Hi-C技术组装出染色体级别的盐肤木基因组（357.62 Mb），包含15对染色体（2n=30）。基因组注释显示53.17%为重复序列，预测蛋白编码基因24,039个。系统进化分析表明盐肤木与开心果（Pistacia vera）亲缘关系最近，分化时间约1460万年前，并共享古老的WGD事件（Ad-γ）。扩张基因家族显著富集于防御反应（GO:0006952）、几丁质分解代谢（GO:0006032）及黄酮生物合成通路，从基因组层面解释了其广泛环境适应性的基础。

防御相关基因家族的扩张与功能验证

几丁质酶基因家族在盐肤木中显著扩张（53个成员），特别是GH19家族的II类和IV类。RNA-seq及qRT-PCR证实RcChiC（YFM011904）和RcCTL1（YFM002752）在盐和热胁迫下被强烈诱导。瞬时过表达实验表明这两个基因能通过提高CAT/POD活性、降低ROS积累来增强耐逆性。此外，苯丙氨酸解氨酶（PAL）和查尔酮合成酶（CHS）基因家族通过串联复制显著扩张（12个PAL和28个CHS），其中RcPAL（YFM22723）和RcCHS（YFM002893）的过表达显著增加烟草中黄酮含量，并在酵母和烟草中赋予耐热耐盐表型。

五倍子中单宁生物合成与水解的调控机制

代谢组学检测发现五倍子（Galla chinensis）中富含酚酸（20.2%）、黄酮（18.3%）和单宁类物质，其中没食子酸（GA）含量最高。研究鉴定出3个串联复制的单宁酶基因（RcTA1-3），其中RcTA1（YFM001237）在五倍子中高表达，与GA含量呈正相关。体外酶活实验证明RcTA1可催化五没食子酰葡萄糖（PGG）和表没食子儿茶素没食子酸酯（EGCG）水解生成GA。进一步通过酵母单杂交和双荧光素酶实验发现MYB转录因子RcDIV1可直接结合RcTA1启动子（MBS位点TAACCAGTCGTG）并激活其转录，从而调控水解单宁的积累。

腺毛发育与盐胁迫适应的结构基础

显微结构观察显示盐肤木腺毛为多细胞头状结构，果皮腺毛密度（288.49 n/μm²）和尺寸显著大于叶片。同源分析鉴定出RcGL1、RcGL3、RcTTG1等腺毛发育关键基因，其中RcGL2（YFM023864）在果皮中特异性高表达。免疫组化和Western blot证实RcGL2蛋白在腺毛细胞核富集。在拟南芥中过表达RcGL2可增加叶片茸毛数量，并通过增强腺毛尖端Na⁺外排（NMT检测显示efflux速率提高2倍）和激活抗氧化酶系统（SOD/POD/CAT/APX）提高耐盐性。

离子/代谢物转运与盐适应机制

果皮分泌物代谢组分析发现富含黄酮（18%）、酚酸（17%）和脂质（14%）。元素分析显示分泌物中Cl、S、Ca元素富集。转录组数据表明果皮中离子转运相关基因（HKT、CLC、ABCG等）显著上调。盐胁迫下，SOS信号通路基因（SOS1/2/3）及ABA生物合成基因（NCED、SDR）被激活，同时扩张的ABCG转运蛋白（86个成员）可能参与代谢物和离子的跨膜运输。这些发现揭示了腺毛通过主动运输和沉积机制形成盐晶状覆盖物的分子基础，为理解盐肤木的先锋植物特性提供了新视角。