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为探究相分离对细胞衰老的影响,研究人员以人骨髓间充质干细胞(hMSCs)为对象研究 MRG15。发现 MRG15 缺失会导致细胞衰老,其通过内在无序区域(IDR)形成相分离液滴至关重要,这为抗衰及相关疾病治疗提供新靶点。
在生命的长河中,细胞衰老就像一个神秘的 “开关”,它不仅与个体的衰老进程紧密相连,还和多种年龄相关疾病的发生发展息息相关。目前,虽然科学家们已经对衰老过程有了一些了解,但细胞衰老背后那些复杂的分子机制,尤其是生物大分子在其中的 “秘密行动”,依旧隐藏在重重迷雾之中。比如,细胞内的生物大分子是如何重新组织,进而调控细胞功能的呢?这一问题一直困扰着科研人员。而相分离作为细胞内一种重要的生物物理过程,它在转录调控中发挥着关键作用,可它对细胞衰老的影响究竟有多大,还亟待深入探索。
在这样的背景下,杭州师范大学等机构的研究人员勇挑重担,开展了关于 MRG15 在细胞衰老中作用的研究。他们的研究成果发表在《Communications Biology》杂志上,为我们揭开了细胞衰老调控的新篇章。
研究人员在探索细胞衰老的奥秘时,采用了多种关键技术方法。其中,染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)技术帮助他们确定 MRG15 在基因组上的结合位点,了解其对基因表达的调控机制;RNA 测序(RNA-seq)技术则让他们能够全面分析细胞内基因表达的变化情况,洞察细胞衰老过程中的分子变化;免疫共沉淀(Co-IP)联合质谱(MS)分析,助力他们发现与 MRG15 相互作用的蛋白质,揭示其在细胞内的作用网络 。研究过程中使用的样本主要是人骨髓间充质干细胞(hMSCs)。
研究人员的探索之旅收获颇丰,下面我们一起来看看他们的主要研究结果:
- MRG15 在细胞核中形成凝聚体:研究人员发现,作为转录因子的 MRG15 能在细胞核中形成许多大小不一的点状结构,也就是凝聚体。通过分析,他们确定 MRG15 的 89 - 150 氨基酸序列是内在无序区域(IDR),这个区域对其相分离行为起着决定性作用。无论是在活细胞还是固定细胞中,当 MRG15 标记绿色荧光蛋白(GFP)后,都能观察到核内的点状结构,而缺失 IDR 的突变体则呈现均匀分布。不仅如此,MRG15 凝聚体还具有融合、裂变等动态行为,光漂白后荧光恢复(FRAP)实验也证实其具有类似液体的特性,并且 1,6 - 己二醇处理后凝聚体会迅速溶解,这些都充分表明 MRG15 能发生液 - 液相分离(LLPS)。
- MRG15 体外也能发生相分离:在体外实验中,纯化的 GFP 标记的全长 MRG15 能自发形成液滴,而缺失 IDR 的突变体则无法形成。MRG15 凝聚体对离子强度变化很敏感,随着蛋白质浓度增加,会形成更大的液滴。FRAP 实验显示,MRG15 分子在凝聚相中能自由移动,而且液滴还会发生融合、解离等动态变化,这些都再次证明 MRG15 在体外也能发生 LLPS,且具有动态液体凝聚体的特征。
- MRG15 缺失加速细胞衰老:在人骨髓间充质干细胞(hMSCs)中,MRG15 的表达水平与细胞衰老密切相关。随着细胞衰老,MRG15 表达下调,在阿尔茨海默病等衰老相关疾病中也有类似现象。通过敲低 MRG15,研究人员发现 SA - β - gal+细胞增多,细胞增殖能力受限,Ki67 阳性细胞比例减少,p53 及其磷酸化水平升高,衰老相关基因 p21 表达上调,同时细胞的 DNA 损伤反应也出现缺陷。这些结果都表明,MRG15 缺失会加速 hMSCs 的衰老进程。
- IDR 介导的 MRG15 相分离对细胞衰老至关重要:研究人员将 MRG15 和缺失 IDR 的 MRG15ΔIDR 分别导入衰老的 MSCs 中,发现补充 MRG15 能减少 SA - β - gal 阳性细胞数量,增加 Ki67 阳性细胞数量,而补充 MRG15ΔIDR 则无明显效果。此外,用其他能形成液体样凝聚体的 IDR 替换 MRG15 的 IDR 后,能恢复液滴形成,并且使 MRG15 缺失的 MSCs 恢复正常功能。这一系列实验充分证明,IDR 介导的 MRG15 LLPS 参与了 MSC 衰老过程。
- MRG15 凝聚体在细胞衰老和细胞周期通路中发挥作用:通过 Co - IP 联合 MS 分析,研究人员鉴定出许多与 MRG15 相互作用的蛋白质。与 MRG15 结合的蛋白质具有更高的相分离预测得分,且参与蛋白质 - DNA 复合物组装、细胞器组装调控等重要细胞过程;而与 MRG15ΔIDR 结合的蛋白质则主要参与细胞成分拆解等功能。ChIP - seq 和 RNA - seq 分析表明,MRG15 靶向细胞周期相关基因(如 CDKN1A、CCNB1)和细胞衰老相关基因(如 CDKN1A、LMNB1、NPM1、HMGB2、MYC ),影响这些基因的表达,进而调控细胞衰老和细胞周期通路。
综合研究结果和讨论部分的内容,这项研究具有极其重要的意义。它首次明确了 MRG15 通过 IDR 介导的 LLPS 在细胞衰老调控中起着关键作用。MRG15 能促进蛋白质 - DNA 复合物的组装,调节细胞周期和细胞衰老相关基因的表达,从而延缓细胞衰老。这一发现为我们理解细胞衰老的分子机制提供了全新的视角,也为开发针对衰老相关疾病的治疗策略开辟了新的方向。MRG15 有望成为一个极具潜力的治疗靶点,未来或许可以通过调节 MRG15 的功能,干预细胞衰老进程,为延缓衰老、治疗相关疾病带来新的希望 。