Q-PHAST:低成本大规模微生物表型定量分析与药敏检测新方案

【字体: 时间:2025年05月13日 来源:Nature Protocols 13.1

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  来自Gabaldonlab的研究人员开发了Q-PHAST(定量表型与抗菌药敏检测)系统,通过96孔深孔板培养结合平床扫描仪动态监测技术,实现了微生物群体生长、适应度(如倍增速率)和药敏性(如最小抑菌浓度MIC)的高通量定量分析。该系统采用开源Python软件和廉价材料,三天内仅需每日<120分钟人工操作即可完成数百菌株并行检测,为资源有限实验室提供了精准表型研究工具。

  

这项名为Q-PHAST(Quantitative PHenotyping and Antimicrobial Susceptibility Testing)的技术为微生物实验室提供了一种革命性解决方案。研究者巧妙利用普通96孔深孔板培养单菌落,通过稀释后在不同浓度抗菌物质的固体培养基上生成96个菌落斑点。这些培养皿被置于经济型平床扫描仪上,每15分钟自动捕获生长图像。

配套开发的Python开源软件(可跨平台图形化操作)能精准分析图像数据,推算关键参数:包括生长曲线、适应度指标(如倍增速率doubling rate)和药敏特性(如最小抑菌浓度MIC)。整个流程仅需连续三天、每日不足两小时的手动操作,即可获得可直接使用的数据图表。

该技术突破性地将高通量表型分析(large-scale phenotyping)的门槛降低到常规实验室水平,无需昂贵机器人设备。通过标准化操作流程和智能图像算法,即使是资源有限的研究者也能对数百微生物菌株进行精确的定量表型分析和药敏检测,为临床微生物研究和抗菌药物开发提供了强有力的工具。

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