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该研究针对超罕见儿童实体瘤肌上皮癌，探索肿瘤 RNA 测序（RNA-Seq）在临床靶向治疗中的应用。通过比较分析 RNA 表达（CARE）框架，结合大基因组数据集，成功为患者找到有效治疗方案，凸显数据共享和多组学分析对罕见癌诊疗的价值。
研究背景与方法
儿童癌症中高危或复发难治性病例预后差，精准医学成为重要方向。肿瘤基因组分析虽在成人和儿童癌症中找到治疗靶点，但儿童癌症体细胞编码突变较少，更多存在拷贝数变异、基因融合等。RNA-Seq 除鉴定基因融合外，其表达分析或可挖掘新靶点，但缺乏统一标准。CARE 框架通过将患者肿瘤 RNA-Seq 与超 1.1 万肿瘤样本比较，结合通路分析识别过表达异常基因，为治疗提供依据。
病例介绍与分析
4 岁男性患儿因肝肿块确诊 INI-1 缺失的肌上皮癌，术后复发出现肺转移。DNA 检测仅显示SMARCB1缺失，无可用突变靶点。对肺转移灶进行 RNA-Seq 并经 CARE 分析，发现FGFR1、FGFR2、PDGFRA等受体酪氨酸激酶过表达，富集于 FGFR 和 PDGF 信号通路，可被帕唑帕尼靶向；同时CCND2过表达，伴随细胞周期相关通路激活，提示 CDK4/6 抑制剂瑞博西尼可能有效。免疫组化证实肿瘤中 CDK4 过表达，而视网膜母细胞瘤蛋白完整。
治疗过程与结果
初始选用帕唑帕尼治疗 3 个月后疾病进展，随后通过单患者新药申请使用瑞博西尼液体剂型。治疗期间肺结节稳定，术后继续用药 12 周期，2.5 年随访无复发，且未出现明显长期毒性。
讨论与意义
该病例显示，对于缺乏可靶向突变的罕见癌，结合大样本 RNA-Seq 数据的无偏分析可发现潜在治疗靶点。CARE 框架通过标准化流程和多队列比较，克服了基因表达分析的局限性，为罕见癌的生物学研究和治疗提供了新工具。例如CCND2和 CDK4 在肌上皮癌中的发现，不仅拓展了对该疾病的认知，也为后续患者通过免疫组化筛选 CDK4/6 抑制剂治疗提供了依据。研究强调数据共享和多组学整合在精准肿瘤学中的重要性，为未来难治性儿童癌症的治疗开辟了新方向。
