基于血浆代谢物机器学习分析的类风湿关节炎骨破坏早期预测研究

【字体: 时间:2025年05月22日 来源:Arthritis Research & Therapy 4.4

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  为解决类风湿关节炎(RA)骨破坏早期预测难题,研究人员基于血浆代谢物特征和临床指标,开发预测模型。通过 LC-MS 检测代谢物,利用机器学习筛选核心代谢物,构建 CjBM 模型,其 AUC 达 0.800,为 RA 骨破坏早期预警提供新方向。

  
类风湿关节炎(RA)是一种侵蚀性自身免疫病,会引发关节软骨和骨破坏,导致残疾,严重影响患者生活质量。早期准确预测骨破坏对及时干预至关重要,但传统临床指标如 C 反应蛋白(CRP)、类风湿因子(RF)等敏感度和特异度有限,尤其在血清阴性患者或接受药物治疗者中效果不佳,因此亟需新的生物标志物和预测模型。

中国 - 日本友好医院的研究团队开展了相关研究,旨在基于血浆代谢物特征和常见临床指标,开发 RA 骨破坏的早期预测模型。研究成果发表在《Arthritis Research & Therapy》。

研究采用了以下关键技术方法:

  • 样本队列:从中国 - 日本友好医院随机选取 60 例 RA 患者,采集基线血浆样本,随访 1 年,通过 van der Heijde 改良总 Sharp 评分(mTSS)评估放射学结局,以 ΔmTSS 中位数将患者分为 “缓慢进展” 和 “快速进展” 组。
  • 代谢物检测:利用液相色谱 - 质谱联用(LC-MS)系统检测血浆代谢物,通过 KEGG、HMDB 等数据库鉴定代谢物。
  • 机器学习分析:运用 LASSO 回归、高斯朴素贝叶斯(GNB)等多种算法筛选核心代谢物,构建骨侵蚀风险评分(BERS)和 “中国 - 日本友好医院 - BERS 模型(CjBM)”,并通过 ROC 曲线、决策曲线分析(DCA)等评估模型性能。

研究结果


基线特征与代谢物差异


60 例患者基线 mTSS 中位数为 13.50,随访 1 年 ΔmTSS 中位数为 3.50。慢进展组甲氨蝶呤(MTX)使用率显著高于快进展组。检测到 774 种代谢物,其中 77 种在两组间存在差异,多数属于脂质类,提示脂质代谢与骨破坏密切相关。

核心代谢物筛选


通过 LASSO 回归和 GNB 算法,筛选出 4 种核心代谢物:芒果酸、O - 乙酰 - L - 肉碱、5,8,11 - 二十碳三烯酸、16 - 甲基十七烷酸。这些代谢物在快进展组水平较低,与 ΔmTSS 呈负相关。基于其表达水平和重要性计算的 BERS 显示,高 BERS 组快速进展风险显著更低(OR=0.01,95% CI=0.01-0.03,P=0.003)。

预测模型构建与评估


CjBM 整合 BERS、MTX 和 CRP,ROC 曲线下面积(AUC)为 0.800,显著优于仅含临床指标的模型(AUC=0.692,PDeLong=0.045)。与既往模型相比,CjBM 在识别快速进展方面表现更优,加入 BERS 可提升原有模型的区分度(PDeLong=0.035)。

结论与讨论


研究开发的 CjBM 模型结合代谢物特征和临床指标,为 RA 骨破坏提供了新的预测工具。核心代谢物如芒果酸通过抗氧化、抑制 NF-κB 通路等机制发挥作用,提示代谢物不仅是预测标志物,还可能成为治疗靶点。尽管样本量较小,需进一步验证,但该研究首次将代谢组学与机器学习结合,为 RA 精准医疗奠定了基础,有望通过动态监测代谢特征实现早期干预,延缓骨破坏进程。

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