大额牛(Bos frontalis)脾脏比较转录组分析揭示其适应恶劣环境的免疫模式

【字体: 时间:2025年05月22日 来源:BMC Genomics 3.5

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  为探究大额牛免疫功能,研究人员对比其与云南黄牛脾脏转录组。发现大额牛体液免疫更强、促炎细胞因子水平更低,鉴定出 708 个差异表达基因(DEGs),富集于免疫相关通路。该研究为牛抗病育种提供新方向。

  

论文解读


在我国云南怒江、独龙江流域的亚热带雨林与高山峡谷间,生活着一种神秘的半野生牛科动物 —— 大额牛(Bos frontalis)。它们以竹类、灌木枝叶为食,在复杂气候与病原体环绕的环境中演化出独特生存能力。然而,这一珍稀物种的免疫机制长期未被系统解析。现有研究虽发现其血红蛋白合成能力与牦牛相近,白细胞水平及脾脏趋化因子、细胞因子表达也显示出一定抗病潜力,但关于其免疫功能的全貌,尤其是与家养牛种的差异,仍笼罩在迷雾之中。野生动物往往面临更高的病原体暴露压力,其免疫应答是否以体液免疫(如抗体介导)为主导?大额牛是否通过独特的脾脏基因表达模式适应恶劣环境?这些问题不仅关乎物种保护,更为家畜抗病育种提供关键线索。

为揭开这些谜团,云南农业大学动物科学技术学院的研究团队开展了一项跨学科研究。他们以 2 岁龄、体重相近的 8 头大额牛和 8 头云南黄牛为对象,通过血清免疫因子检测、脾脏转录组测序(RNA-seq)及生物信息学分析,首次系统性比较了两者的免疫状态与基因表达差异。研究成果发表在国际知名期刊《BMC Genomics》,为理解野生牛科动物的环境适应机制开辟了新视角。

研究方法


研究采用多维度技术手段:

  1. 样本采集与免疫指标检测:采集血清及脾脏组织,利用酶联免疫吸附试验(ELISA)测定 IL-1β、IL-8、IFN-γ、TNF-α 等促炎 / 抗炎细胞因子,以及 IgA、IgG、IgM 等免疫球蛋白水平,同时检测脾脏总抗氧化能力(T-AOC)、丙二醛(MDA)等抗氧化指标。
  2. 转录组测序与分析:提取脾脏 RNA,构建测序文库后进行 Illumina NovaSeq X Plus 双端测序,通过 HISAT2 比对到黄牛参考基因组,利用 DESeq2 筛选差异表达基因(DEGs),并进行 KEGG 通路与 GO 富集分析。
  3. 实时荧光定量 PCR(RT-qPCR)验证:选取 CD38、IL-8、TRBV 等 10 个 DEGs,通过 qPCR 验证转录组数据的准确性。
  4. 相关性分析:运用 Spearman 秩相关检验,分析基因表达与免疫球蛋白水平的关联,构建调控网络。

研究结果


  1. 血清免疫状态差异
    大额牛血清中促炎细胞因子 IL-8、IFN-γ、TNF-α 水平显著低于云南黄牛(P<0.05),而 IgG、IgM 浓度显著升高(P<0.05),IgA 水平呈上升趋势(0.05<>

  2. 脾脏转录组特征

    • 差异表达基因:共鉴定出 708 个 DEGs,其中 365 个上调、343 个下调。上调基因富集于 “primary immunodeficiency”“hematopoietic cell lineage” 等免疫相关 KEGG 通路,以及趋化因子受体活性(GO:0004950)、白细胞黏附(GO:0007159)等 GO 条目;下调基因则与 T 细胞受体复合物(GO:0042101)、胸腺 T 细胞选择(GO:0045061)等 T 细胞相关功能密切相关。
    • 关键基因验证:qPCR 证实,大额牛脾脏中 B 细胞受体(BCR)、免疫球蛋白重链基因(IGH)、IgA、IgM 等基因表达上调,而 T 细胞受体 β 链(TRBV)、CD3 复合体(CD3D、CD3E)、CD8α、酪氨酸激酶(LCK、ZAP70)等显著下调,与转录组结果一致。

  3. 免疫球蛋白与基因表达的关联
    相关性分析显示,CD1、CD36、CD38、CXCL8 等基因与脾脏 IgA、IgG、IgM 呈正相关(R>0.5,P<0.05),而 ANPEP、CD3D、CD8A、MHC I 等与免疫球蛋白水平负相关(R<-0.5,P<0.05),提示 B 细胞活化与 T 细胞抑制可能是大额牛体液免疫增强的关键机制。

  4. 抗氧化能力与免疫模式总结
    两者脾脏抗氧化指标(T-AOC、GSH-Px、SOD 等)无显著差异,表明大额牛的环境适应主要依赖免疫调控而非抗氧化系统。研究构建了 “B 细胞分化增强 - T 细胞应答抑制” 的免疫模式图,揭示其通过提升抗体生成能力、降低细胞免疫活化水平,在病原体压力与自身炎症损伤间达成平衡。


结论与意义


本研究首次通过多组学手段揭示了大额牛适应恶劣环境的核心机制:以脾脏免疫球蛋白基因(IgH、IgA、IgM 等)高表达和 B 细胞分化为特征的体液免疫增强,伴随 T 细胞受体信号通路的系统性下调。这一 “重体液、轻细胞” 的免疫策略,可能是野生牛科动物在长期病原体暴露中演化出的适应性选择,既保证了对多样病原的有效应答,又避免了过度炎症损伤。

研究结果不仅为理解野生物种的免疫演化提供了新模型,更为家畜抗病育种开辟了新思路。例如,通过靶向调控 BCR-ABL 信号通路或 IgH 基因表达,可能培育出具有更强天然免疫力的牛种。此外,大额牛特有的免疫基因模块(如 CD38、CXCL8)或成为开发新型免疫佐剂的潜在靶点。

值得注意的是,受限于野外采样条件,研究未深入分析淋巴细胞亚群的动态变化,未来需结合单细胞测序与流式细胞术,进一步解析其免疫细胞图谱。但无论如何,这项研究已为我们打开了一扇窗,让我们得以窥见大自然塑造免疫奇迹的智慧。

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