
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
优化定量检测猪肉香肠中戊型肝炎病毒方法的验证及其在食品安全监测中的应用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月03日 来源:Food and Environmental Virology 4.1
编辑推荐:
为解决戊型肝炎病毒(HEV)通过猪肉制品传播的公共卫生问题,瑞典研究团队开发并验证了一种基于RT-qPCR和RT-ddPCR的HEV定量检测方法。该研究整合了Tri-reagent相分离与异丙醇沉淀技术,在猪肉香肠中实现了200 copies/g的检测限(LOQ),为食品安全风险评估提供了高精度工具。研究证实RT-ddPCR并未显著提升检测性能,而异丙醇沉淀法比磁珠提取效率高2-16倍,相关成果发表于《Food and Environmental Virology》。
戊型肝炎病毒(HEV)作为一种新兴的人畜共患病原体,正日益威胁全球公共卫生安全。研究表明,全球约12%人口曾感染HEV,其中基因3型和4型可通过未煮熟的猪肉制品传播,尤其是香肠、肝脏等加工食品。尽管HEV感染通常表现为自限性疾病,但在免疫功能低下人群中可能导致慢性感染、急性肝衰竭甚至神经系统并发症。当前食品中HEV检测面临重大挑战:现有方法缺乏标准化定量验证,不同实验室采用的提取技术和检测手段差异较大,且对低病毒载量样本的检测能力不足。
为应对这些挑战,来自瑞典的研究团队在《Food and Environmental Virology》发表了突破性研究成果。他们开发了一种整合Tri-reagent相分离与异丙醇沉淀的HEV RNA提取方案,并系统比较了实时荧光定量PCR(RT-qPCR)与微滴式数字PCR(RT-ddPCR)的检测性能。研究首次参照ISO 15216-1标准对猪肉香肠中的HEV进行方法学验证,建立了可支持食品安全监管的标准化定量检测体系。
关键技术方法包括:1)使用野生野猪肝脏制备天然HEV-3型毒株作为加标材料;2)结合IKA匀浆器与Tri-reagent/1-溴-3-氯丙烷进行样品处理;3)平行比较异丙醇沉淀与磁珠法(NucliSENS miniMAG)的RNA提取效率;4)采用Jothikumar等设计的引物探针系统,通过WHO国际标准品验证检测准确性;5)通过七轮重复实验确定方法性能参数。
方法优化与验证
研究团队整合了Mykytczuk和Szabo两种前处理方法,建立三步检测流程:样品匀浆释放病毒RNA、Tri-reagent相分离、异丙醇沉淀浓缩。使用Frankfurter香肠作为模型基质,通过七轮重复实验证明该方法在RT-qPCR和RT-ddPCR中均达到200 copies/g的95%检测限(LOD95%)和定量限(LOQ)。值得注意的是,RT-ddPCR在阴性对照中出现假阳性信号,提示需建立空白限值标准。
技术比较
突破性发现在于:虽然RT-ddPCR理论上具有绝对定量优势,但实际检测中与RT-qPCR的定量结果高度一致(平均差异仅10%),且RT-qPCR精密度更优(残差SD 0.14 vs 0.20)。使用WHO标准品验证显示,该方法检测值(256,000 copies/mL)与国际单位(250,000 IU/mL)几乎完全吻合。
提取效率突破
异丙醇沉淀法展现出显著优势:比磁珠法提取总RNA量更高(p=0.016),配合耐受抑制剂的TaqPath Mastermix A时,HEV检出浓度提升2-16倍。病毒提取效率评估显示,HEV和过程控制病毒(mengovirus)回收率分别达137%和118%,远超ISO 15216-1规定的1%阈值。
序列保守性分析
通过对834株HEV基因组序列的生物信息学分析,证实所用引物探针在ORF2/ORF3重叠区具有广谱覆盖性:正向引物匹配率59%(41%单碱基错配),探针和反向引物匹配率均超过90%。WHO参考面板测试进一步验证了该方法对1-7基因型的检测能力。
这项研究为食品HEV检测建立了金标准:1)首次系统验证了定量方法的性能参数;2)明确了异丙醇沉淀法在复杂食品基质中的优势;3)纠正了数字PCR必然优于qPCR的认知偏差。研究者特别指出,虽然采用人工加标样本存在局限性,但该方法已成功应用于天然感染的野猪肝脏检测(见补充材料)。该成果不仅为食品安全监管提供可靠工具,其方法学验证框架更可推广至其他食源性病毒检测领域。随着ISO/TC 34/SC 9/WG31正在制定的HEV检测国际标准,这项研究将为全球食品安全体系提供关键技术支撑。
生物通微信公众号
知名企业招聘