先天淋巴细胞谱系分化的表观遗传印记机制解析

来自Wang团队的研究人员通过单细胞多组学技术揭示了ILC前体细胞中DNA甲基化印记如何指导ILC1/2/3亚群谱系分化的新机制，发现特异性甲基化区域（SMRs）的表观遗传编程决定了免疫细胞发育命运，为免疫细胞分化调控提供了重要理论依据。

　　

研究人员通过同步分析先天淋巴细胞（ILC）亚群及其前体细胞（ILCP）的单细胞DNA甲基化组、染色质可及性和转录组，发现ILCP可划分为两个亚群（ILCP1和ILCP2）。其中ILCP2具有高度异质性的DNA甲基化特征，可根据其甲基化模式进一步分为三类，分别与ILC1、ILC2和ILC3亚群的表观遗传特征相匹配。

研究团队鉴定出每个ILC亚群的特征性甲基化区域（SMRs），并追踪了ILCP分化过程中的DNA甲基化印记动态。结果显示，携带特定ILC亚群低甲基化SMRs特征的ILCP2细胞会定向分化为对应亚群。通过表观遗传编辑技术干预SMRs的甲基化状态会抑制ILC谱系分化，而敲除ILCP中的DNA甲基转移酶Dnmt1则消除了SMRs的异质分布模式，导致ILC分化缺陷。

这项研究首次证实表观遗传印记在免疫细胞发育过程中对谱系命运决定的调控作用，为理解黏膜免疫稳态的维持机制提供了新的表观遗传学视角。