基于新型喹唑啉-苯并三唑骨架的RIPK1抑制剂设计、合成与抗急性缺血性脑卒中应用研究

《Bioorganic Chemistry》:Identification of novel selective estrogen receptor degraders (SERD) via physics-based and deep-learning-based virtual screening and Bioassys

【字体: 时间:2025年09月25日 来源:Bioorganic Chemistry 4.7

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  本文创新性地设计并合成了一系列以喹唑啉-苯并三唑为核心骨架的新型RIPK1抑制剂,通过酶活筛选与细胞实验验证了化合物9b对RIPK1/RIPK3/MLKL通路的特异性抑制能力。该研究首次报道了兼具II/III型抑制剂特征的双位点结合模式,并在大鼠MCAO模型中证实其低毒性、高血脑屏障穿透性及神经保护作用,为急性缺血性脑卒中(AIS)治疗提供了极具临床前景的候选化合物。

  

Highlight

基于结构的理性设计:

RI-962(图2A)是一种通过生成式深度学习模型设计的有效抑制剂。它可通过抑制RIPK1激酶活性,改善TNFα诱导的全身性炎症反应综合征(SIRS)和葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导的炎症性肠病(IBD)损伤。在RI-962与RIPK1结合的晶体结构(图2B)中,5-(2-异丁酰胺基-[1,2,4]三唑并[1,5-a]吡啶-7-基)部分插入ATP结合口袋,而N-(3-(三氟甲基)苄基)酰胺链则延伸至变构口袋。这种独特的结合模式同时占据了II型和III型抑制剂的结合位点,为设计新型双位点抑制剂提供了关键思路。

Conclusions

本研究成功设计并合成了一系列具有喹唑啉结构的RIPK1抑制剂(化合物9a-9u)。体外生物学评估表明,这些化合物能选择性抑制RIPK1,并显著保护HT-29和HT-22细胞免受TSZ诱导的坏死性凋亡。特别值得注意的是,化合物9b表现出最低的细胞毒性,同时对L929和U937两种细胞类型也展现出保护作用。该化合物通过抑制坏死性凋亡通路中RIPK1、RIPK3和混合谱系激酶样结构域(MLKL)的磷酸化,实现了细胞层面的神经保护功能。

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