使用培养组学技术研究储存条件对部分加工过的粪便微生物群移植产品中活细菌的影响

《Letters in Applied Microbiology》：Impact of storage conditions on live bacteria in partially processed faecal microbiota transplantation products using culturomics

粪菌移植（FMT）治疗艰难梭菌感染需解决制备流程耗时费力问题，本研究评估5℃和-80℃储存对部分处理FMT材料中活菌浓度及组成的影响。结果显示-80℃储存72小时能有效保持细菌数量及菌群结构，而5℃储存导致细菌浓度下降及拟杆菌门减少，提示冷冻储存更适合维持FMT产品质量。

　　

摘要

粪便微生物群移植（FMT）是治疗艰难梭菌感染的有效方法，但目前的FMT产品制造流程对时间要求较高、劳动强度大，并需要专业人员进行操作。任何延误都可能影响微生物的存活率和产品质量。因此，开发高效的半加工FMT材料储存方法可以提高生产灵活性并简化生产流程。本研究通过实验评估了储存条件对含有甘油作为冷冻保护剂的半加工捐赠物中活细菌的影响。利用培养组学技术，我们检测了样品在处理中途（参考时间0小时）以及储存于5°C（冰箱）或-80°C（冷冻柜）长达72小时后的活细菌浓度和组成变化。每种FMT产品最初都是由四位经过筛选的捐赠者提供的粪便样本制成的。结果显示，在-80°C下储存能够有效保持半加工产品中活细菌的数量和组成；而在5°C下储存则会导致细菌浓度下降及细菌组成发生变化，尤其是拟杆菌属细菌的数量减少。这些结果表明，冰箱储存条件可能对细菌存活率产生不利影响，因此可能不适合用于维持半加工FMT产品的质量。相比之下，冷冻储存是一种可靠的保存方法，能够至少在72小时内保持活细菌的有效性。