3D-MINFLUX纳米显微技术揭示Yoda1通过变构机制差异化激活与调控PIEZO1的新范式
《Nature Communications》:3D-MINFLUX nanoscopy reveals distinct allosteric mechanisms for activation and modulation of PIEZO1 by Yoda1
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时间:2025年12月18日
来源:Nature Communications 15.7
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本研究针对小分子Yoda1调控机械敏感离子通道PIEZO1的机制争议,通过3D-MINFLUX纳米显微技术、电生理学与计算模拟,发现Yoda1通过结合THU8-9界面不同位点(A2094W突变仅废除激活,F1715突变仅影响调控),首次阐明其激活与调控功能依赖独立的变构通路,为设计靶向PIEZO1的精准调控药物奠定基础。
机械敏感离子通道PIEZO1作为细胞感知物理力的核心分子,在血管重塑、红细胞体积调节等生理过程中发挥关键作用。然而,其特异性小分子激动剂Yoda1的作用机制长期存在争议:传统模型认为Yoda1通过结合THU8-9界面诱导通道扁平化,进而激活并调控机械敏感性,但这一假说缺乏直接证据。更棘手的是,Yoda1同时引发钙内流(激活)和机械电流调制(调控),导致实验中被观察到的效应难以区分究竟是PIEZO1机械敏感性的真实反映,还是药物直接引发的钙超载假象。这一局限性严重阻碍了PIEZO1在病理生理研究中的精准应用。
为解决该问题,德国汉堡大学医学中心Stefan G. Lechner团队在《Nature Communications》发表研究,结合3D-MINFLUX纳米显微、点突变、电生理学与计算模拟,首次揭示Yoda1通过离散变构路径分别介导PIEZO1激活与调控。
研究采用位点定向突变构建PIEZO1变异体(A2094W、V1714A_F1715A等),通过膜片钳记录机械电流(压力钳与戳刺法)和GCaMP8/jRGECO1a钙成像分析药理学反应;利用DoGSite3与AutoDock Vina算法预测Yoda1结合口袋;通过3D-MINFLUX/DNA-PAINT纳米显微技术在完整细胞中直接测量通道扁平化(以叶片间距为指标);所有统计均基于至少3次独立实验,采用参数或非参数检验验证显著性。
1. 破坏推定变构结合位点废除Yoda1诱导的PIEZO1激活但不影响调控
A2094W突变完全阻断了Yoda1引发的钙内流(图1B),却保留了对机械电流的调制作用(图1C-D)。该突变体对机械刺激的反应与野生型无差异,表明力传导通路未受损,但Yoda1的激活功能特异性丧失。
2. 计算模拟揭示扁平化状态中涌现的替代Yoda1结合位点
DoGSite3分析显示,PIEZO1从弯曲(PDB:7WLT)到扁平(PDB:7WLU)构象时,THU8-9界面深处出现新的结合口袋(图2A橙色网格)。分子对接表明,F1715在扁平构象中与78%的Yoda1结合位点毗邻(图2C),提示其可能参与开放状态下的药物结合。
使用高溶解度类似物Yoda2的实验进一步验证:A2094W仅使EC50右移(从0.03 μM至7.03 μM),最大响应仍可达到野生型水平(图3A-B);而V1714A_F1715A突变体虽正常激活(EC50=0.067 μM),却丧失低浓度Yoda2(30 nM)对机械电流的调制能力(图3C-D)。
4. MINFLUX纳米显微提示结合位点I而非II参与Yoda诱导的PIEZO1扁平化
3D-MINFLUX直接测量显示,Yoda1使野生型PIEZO1叶片间距增加2.19 nm(图4D),而A2094W突变体无此变化(图4E)。相反,V1714A_F1715A突变体仍可被Yoda1扁平化(图4F),却无调制功能,证明扁平化是激活的必要条件,但非调制所需。
本研究修正了Yoda1的作用模型:其通过结合位点I(涉及A2094)触发通道扁平化与激活,而机械力诱导的扁平化则使位点II(涉及F1715)暴露,进而介导对机械敏感性的调制(图5)。该发现不仅解耦了Yoda1的双重功能,更为开发选择性靶向PIEZO1特定变构路径的下一代药物提供了理论框架,有望实现更精准的机械转导调控工具设计。
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