温和条件下小分子催化脱氨技术助力 RNA 中 N6- 甲基腺苷(m6A)转录组水平分析
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时间:2025年04月18日
来源:Nature Chemistry 19.2
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传统化学脱氨方法在严苛酸性条件下进行,限制了其在生物底物中的应用。研究人员开展 N - 亚硝化策略的脱氨研究,实现温和条件下 DNA 和 RNA 可耐受的选择性脱氨。由此开发出化学协同催化辅助 N6- 甲基腺苷测序技术,意义重大。
脱氨反应在基础有机化学和生物化学中都非常重要。传统化学脱氨方法依赖在强酸性条件下使用芳基重氮盐,这限制了其在大多数生物底物中的应用范围。本文介绍了一种在温和条件下进行脱氨的 N - 亚硝化策略,DNA 和 RNA 生物大分子能够耐受这种条件。羰基有机催化剂与路易斯酸催化剂协同催化,促进伯胺形成碳 - 硝基中间体,该中间体重排为 N - 亚硝胺后,可在温和条件下实现未取代的标准 DNA/RNA 碱基的选择性脱氨。利用该方法可将腺嘌呤脱氨转化为次黄嘌呤,逆转录酶或 DNA 聚合酶会将次黄嘌呤识别为鸟嘌呤,而 N6- 甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)位点则抗脱氨,仍被识别为腺嘌呤。这种反应特性使得在碱基分辨率下对腺苷甲基化进行测序的化学温和、低投入检测方法成为可能,该方法被命名为化学协同催化辅助 N6- 甲基腺苷测序(chemical cooperative catalysis-assisted N6-methyladenosine sequencing)。
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