乳酸化修饰相关基因特征在急性心肌梗死诊断与治疗中的创新研究

【字体: 时间:2025年04月29日 来源:Discover Medicine

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  为解决急性心肌梗死(AMI)诊断标志物不足和治疗靶点缺乏的问题,Tao Yi与Qian Lei团队基于乳酸化修饰机制,通过整合GSE62646数据集的多组学分析(包括差异基因筛选、WGCNA模块构建及机器学习算法),鉴定出CA5BP1、CTSD、CD46、CEBPB等4个关键基因,构建了诊断列线图模型。研究揭示了乳酸化通过免疫浸润(如T细胞、巨噬细胞)和转录调控(如VDR)参与AMI病理进程,并通过分子 docking预测了14种潜在治疗药物。该研究为AMI的精准诊断和靶向治疗提供了新策略,发表于《Discover Medicine》。

  

急性心肌梗死(AMI)是全球范围内致死率最高的心血管疾病之一,尽管现有诊疗手段(如心电图和心肌损伤标志物)已取得进展,但早期快速诊断和有效治疗仍面临挑战。近年来,乳酸从单纯的代谢废物“逆袭”为表观遗传调控的关键分子——乳酸化修饰(lactylation)的发现,为心血管疾病研究开辟了新视角。2019年,Zhao团队首次证实组蛋白乳酸化可激活基因转录;2022年Ye团队进一步揭示非组蛋白乳酸化的广泛存在。在心脏疾病中,乳酸化如同一把“双刃剑”:既能通过激活修复基因促进心肌恢复,也可能加剧纤维化。然而,乳酸化与AMI的具体关联机制尚未系统阐明,这正是本研究的突破口。

中国的研究团队通过多学科交叉方法,试图破解这一难题。研究以GEO数据库的GSE62646数据集(28例AMI vs. 13例对照)为核心,结合GSE66360和GSE59867队列验证,整合了差异表达分析(limma包)、功能富集(GO/KEGG/GSEA)、加权基因共表达网络(WGCNA)、机器学习(随机森林/SVM)和分子对接等技术。样本来源于外周血单核细胞和循环内皮细胞,关键分析工具包括CIBERSORT(免疫浸润评估)和Enrichr(转录因子/药物预测)。

3.1 差异基因与功能富集
分析鉴定出4,299个差异表达基因(DEGs),其中1,896个上调,2,403个下调。这些基因富集于B细胞受体通路、NOD样受体信号等免疫代谢通路,GSEA提示染色质修饰酶和线粒体电子传递链功能受抑,凸显乳酸化可能通过代谢-免疫交叉调控影响AMI进程。

3.3 WGCNA关键模块
红色模块(4,511基因)与AMI正相关,暗蓝绿色模块(1,186基因)负相关,模块内基因与乳酸化修饰高度关联,筛选出37个候选基因。

3.4 机器学习筛选枢纽基因
随机森林与SVM算法交叉验证锁定4个核心基因:CA5BP1(新型假基因)、CTSD(介导自噬)、CD46(补体调节蛋白)和CEBPB(炎症转录因子),其ROC曲线下面积(AUC)均>0.9,诊断效能优异。

3.6 免疫浸润分析
AMI患者表现为CD8+ T细胞减少而中性粒细胞增多,枢纽基因与树突细胞、巨噬细胞浸润显著相关,提示乳酸化通过免疫失调加剧心肌损伤。

3.7 转录调控网络
维生素D受体(VDR)被鉴定为调控CEBPB/CTSD的核心转录因子,可能成为干预靶点。

3.8 药物预测
分子对接显示桦木酸(betulinic acid)与CA5BP1结合能达-8.7 kcal/mol,通过疏水作用结合ILE-54等残基,其他13种药物(如雌激素)也显示潜在治疗价值。

这项研究首次系统构建了乳酸化-AMI关联网络,其创新性体现在三方面:一是将表观遗传修饰与AMI免疫微环境动态关联,二是机器学习驱动的多基因诊断模型突破单标志物局限,三是为“代谢-表观遗传-免疫”轴理论提供实证。局限性在于队列样本量较小,且未涵盖NSTEMI亚型。未来需开展前瞻性临床验证,并探索乳酸化修饰的时空调控规律。论文发表于《Discover Medicine》,为AMI的精准医学实践提供了新范式。

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