基于重组酶聚合酶扩增(RPA)和环介导等温扩增(LAMP)的入侵性草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)快速高敏检测新方法

【字体: 时间:2025年05月24日 来源:Scientific Reports 3.8

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  针对入侵性害虫草地贪夜蛾(FAW)形态鉴定困难、传统PCR检测耗时昂贵的问题,印度农业昆虫资源国家局团队开发了基于信号肽基因特异性靶点的RPA和LAMP等温扩增检测法。RPA assay在39°C下30分钟即可通过颜色变化实现100 fg/μL超高灵敏度检测,无需复杂设备,为田间实时监测提供革命性工具。

  

论文解读
背景与挑战
草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)作为全球最具破坏性的入侵性鳞翅目害虫,已对72科353种作物造成威胁,尤其导致亚洲和非洲玉米减产高达34%。其早期幼虫与近缘种(如斜纹夜蛾、棉铃虫)形态高度相似,传统鉴定依赖雄性生殖器解剖或耗时3小时的PCR检测,严重制约田间防控时效。现有LAMP技术虽简化操作,但需60°C高温设备,难以在资源匮乏地区推广。

研究设计与方法
印度农业研究委员会-国家农业昆虫资源局团队通过全基因组in silico(计算机模拟)分析,首次锁定草地贪夜蛾12号染色体上LOC118262236基因中一段编码信号肽(指导蛋白质跨膜运输的短肽序列)的特异序列,据此设计PCR、LAMP(需6对引物)和RPA(仅需2对引物)检测体系。采用50份印度多地采集的草地贪夜蛾样本及7种鳞翅目近缘种为对照,通过以下关键技术验证:

  1. 特异性验证:梯度PCR(52°C)、LAMP(60°C)和RPA(39°C)分别结合电泳或羟萘酚蓝(HNB)/SYBR Green I染料显色;
  2. 灵敏度测试:系列稀释DNA样本(100 ng-10 fg/μL);
  3. 田间验证:跨地理区域样本检测。

核心发现

  1. 特异性验证
  • PCR:仅草地贪夜蛾产生550 bp条带,棉铃虫和蔗螟出现非特异条带;
  • LAMP:阳性样本遇HNB染料变天蓝色(镁离子消耗),阴性保持紫色;
  • RPA:SYBR Green I染料使阳性样本紫外下显亮绿色,阴性为砖红色。
  1. 灵敏度突破
  • PCR最低检测限1 pg/μL,而LAMP与RPA均达100 fg/μL(灵敏度提升10倍);
  • RPA在39°C室温条件30分钟完成检测,无需加热设备。
  1. 田间适用性
  • RPA对50份田间样本检出率100%,且与实验室结果完全一致;
  • 操作人员无需专业培训,仅需UV透射仪观察颜色变化。

意义与展望
该研究首创的RPA检测技术解决了传统分子诊断在成本、设备依赖性和时效性上的三大瓶颈:

  1. 技术革新:首次将RPA应用于鳞翅目害虫检测,其室温操作特性颠覆了现有等温扩增技术依赖加热模块的局限;
  2. 防控价值:为发展中国家小农户提供"口袋实验室"级解决方案,助力FAW早期预警;
  3. 推广潜力:该信号肽靶点设计策略可拓展至其他入侵物种检测体系。

研究团队指出,未来可进一步开发RPA试纸条实现裸眼判读,并探索其在昆虫抗药性监测中的应用。这项发表于《Scientific Reports》的成果,标志着田间分子诊断技术向"无设备化"迈出关键一步。

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