• 单细胞多模态数据整合方法的系统性基准测试与评估

  这篇注册报告开启了一场单细胞多模态数据整合的"奥林匹克竞赛"。随着技术进步，科学家们现在能同时获取非配对（separate profiling）和配对（simultaneous measurement）的单细胞多模态数据集，催生了大量整合工具如雨后春笋般涌现。研究团队对40种整合算法展开了系统性"压力测试"，覆盖DNA、RNA、蛋白质和空间组学（spatial omics）四大模态，针对配对、非配对以及混合型（mosaic）数据集进行全方位评估。就像给算法们做"体检"一样，研究人员从使用便捷性、整合准确度到抗干扰能力（robustness）等多个维度展开测评。这项基准研究如同为单细胞多组学（s

  来源：Nature Methods

  时间：2025-07-11

• 合成兆碱基尺度人类DNA的从头组装与递送技术揭示表观遗传调控新机制

  在生命科学领域，表观遗传修饰如何从零建立始终是未解之谜。天然染色体上的DNA甲基化(DNA methylation)和组蛋白修饰(histone modifications)如同层层叠叠的"分子记忆"，世代相传难以抹除。这种固有特性使得科学家们难以像在空白画布上作画那样，观察表观标记最初是如何被"绘制"到DNA上的。尤其对于人类Y染色体上高度重复的AZFa区域——这个与男性不育直接相关的基因座，其表观调控机制更如同蒙着面纱。天津大学的研究团队在《Nature Methods》发表突破性成果。他们开发了名为SynNICE的革命性技术，首次实现合成兆碱基(Mb)尺度人类DNA的精确组装与活体递送。

  来源：Nature Methods

  时间：2025-07-11

• 单细胞Dam&ChIC技术揭示X染色体失活中的染色质动态重组

  方法设计基因表达的精准调控依赖于染色质组织的多层次协同，包括组蛋白翻译后修饰（hPTMs）、高阶染色质折叠及核支架（如核纤层NL）的相互作用。尽管单细胞技术（如scDamID和sortChIC）已能解析染色质特征，但多数方法仅捕获静态终点，且多因素联用面临数据稀疏性挑战。Dam&ChIC技术通过整合两种核心方法：DamID（利用大肠杆菌甲基转移酶Dam融合目标蛋白，在活细胞中沉积稳定m6A标记以记录历史染色质互作）和sortChIC（通过pA-MNase抗体导向染色质消化获取实时状态）。实验流程包括：诱导Dam-目标蛋白（POI）表达→细胞固定/透化→抗体染色→单细胞分选→pA-MNa

  来源：Nature Cell Biology

  时间：2025-07-11

• 枯草芽孢杆菌MgsR依赖启动子结构表征：新型pHIS质粒筛选系统在启动子元素分析中的创新应用

  细菌的生存依赖于精密的基因调控网络，其中转录控制是关键环节。启动子作为转录起始的“开关”，其核心元素（如-35和-10区域）及操作子（operator）的微小变化可显著影响基因表达强度，进而决定细菌对环境压力（如氧化应激）的适应能力。然而，传统方法分析这些元素在体内的作用耗时且繁琐——直接分离和修饰启动子序列在天然背景下困难重重，且缺乏实时监测工具。以枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）为例，其应激响应机制高度复杂：替代σ因子SigB控制一般应激基因，而次级调控因子如Spx及其旁系同源物MgsR则通过氧化还原敏感开关（CXXC基序）激活特定亚调控网络。尽管Spx的操作子AGCA基

  来源：Nucleic Acids Research

  时间：2025-07-11

• 自适应样本结构与多效性效应解析的高效孟德尔随机化分析方法

  这项研究提出了一种创新的孟德尔随机化(Mendelian randomization, MR)分析方法MAPLE，旨在解决当前MR技术面临的三大挑战。传统MR分析依赖单核苷酸多态性(SNPs)作为工具变量(IVs)，但往往难以同时处理样本结构异质性和SNPs可能存在的多效性效应(pleiotropic effects)。MAPLE方法创造性地采用自适应策略，通过整合相关SNPs信息，构建最大似然框架(maximum-likelihood framework)来精确估计因果效应，并确保p值的准确校准。研究团队通过精心设计的模拟实验证实，与现有八种MR方法相比，MAPLE展现出更优的I型错误控制能

  来源：AJHG

  时间：2025-07-11

• 基于大语言模型的数字孪生技术在罕见妇科肿瘤精准医疗中的应用研究

  在妇科肿瘤领域，罕见肿瘤类型(RGTs)约占所有妇科恶性肿瘤的50%以上，却因年发病率低于6/10万而长期面临临床试验数据匮乏的困境。这类肿瘤具有高度异质性，包含30多种组织学亚型，如性索间质肿瘤和子宫癌肉瘤(UCS)等。传统以器官为基础的分类方式和"一刀切"的治疗方案导致患者预后普遍较差，三线单药治疗的中位无进展生存期(PFS)仅1.8个月。更棘手的是，电子健康记录(EHR)中非结构化的数据和分散的文献资源，使得分子肿瘤委员会(MTB)难以及时获取有效的生物标志物信息来指导治疗决策。德国慕尼黑工业大学医学院(Technical University of Munich, TUM)的Jacqu

  来源：npj Digital Medicine

  时间：2025-07-11

• 氘水标记技术：细胞培养蛋白质组动态分析的革新方法

  论文解读蛋白质作为生命活动的核心执行者，其稳态平衡由合成与降解的动态过程共同维系。蛋白质周转率（protein turnover）的精准测量对于理解细胞分化、疾病机制至关重要。然而，传统技术如稳定同位素氨基酸标记（SILAC）需替换特殊培养基，成本高昂且难以应用于原代细胞；而环己酰亚胺抑制法会干扰蛋白质降解通路。这些限制促使研究者们寻求更普适的技术突破。针对这一挑战，科罗拉多大学医学院（University of Colorado School of Medicine）的研究团队在《Cell Reports Methods》发表创新性成果。他们开发了一种基于氘水（D2O）标记的质谱方法，仅需在

  来源：Cell Reports Methods

  时间：2025-07-11

• 基于漫射相关光谱(DCS)的瘢痕激光治疗血流动力学定量评估新方法

  这项突破性研究将漫射相关光谱(Diffuse Correlation Spectroscopy, DCS)技术引入瘢痕治疗领域，犹如为医生装上了"微血管显微镜"。科研团队设计了一套精密的DCS监测系统，在激光治疗前后实时捕捉瘢痕组织的血流动力学"脉动"。研究招募6名受试者进行双模式验证：血管收缩激光治疗组展现出惊人的"刹车效应"，瘢痕微血管血流(BF)骤降43.27%，功率谱密度(PSD)更出现72%的断崖式下跌；而血管扩张组则呈现"井喷式"响应，BF飙升至338.73%，PSD暴增917%——这些数字跳动如同微循环系统的"心电图"，清晰勾勒出激光治疗的即时效应。该技术突破使得瘢痕治疗评估从"

  来源：Journal of Biophotonics

  时间：2025-07-11

• scMGCL：基于图对比学习的单细胞多组学数据高效整合新方法

  单细胞测序技术的突破让科学家能够以前所未有的分辨率解析细胞异质性，但单模态数据（如仅检测转录组的scRNA-seq或仅检测染色质可及性的scATAC-seq）只能提供细胞状态的片面信息。随着多组学技术的发展，同时检测同一细胞中多个分子层的数据成为可能，但如何整合这些异质性数据仍面临巨大挑战——传统线性降维方法（如PCA）难以捕捉非线性关系，现有算法在计算效率与生物信号保留间难以平衡，跨物种分析时性能波动显著。西安电子科技大学计算机科学与技术学院的研究团队在《Bioinformatics》发表的研究中，提出了scMGCL（single-cell Multi-omics Graph Contras

  来源：Bioinformatics

  时间：2025-07-11

• 基于多模态零样本学习的条件特异性RNA修饰位点预测新方法ExpressRM

  在生命科学领域，RNA修饰如同神秘的分子密码，其中N6-甲基腺苷（m6A）是最丰富的信使RNA修饰，参与从发育到疾病的多种调控过程。然而传统检测技术如MeRIP-seq（甲基化RNA免疫共沉淀测序）成本高昂且通量有限，导致组织特异性修饰图谱严重缺失。更棘手的是，现有计算方法都陷入"同条件训练"的困境——预测脑组织m6A需要先有脑组织的修饰数据，这种"先有鸡还是先有蛋"的矛盾极大限制了研究范围。南京中医药大学江苏省中药功能物质重点实验室的研究团队另辟蹊径，开发出革命性的ExpressRM框架。这项发表于《Briefings in Bioinformatics》的研究突破性地采用多模态零样本学习策

  来源：Briefings in Bioinformatics

  时间：2025-07-11

• 不同胚胎培养介质对辅助生殖技术新生儿出生体重的差异性影响研究

  在当代社会，不孕不育已成为影响8%-12%育龄夫妇的全球性健康问题。辅助生殖技术(ART)作为主要治疗手段，目前全球已有超过1000万ART婴儿诞生。然而越来越多的证据表明，ART婴儿比自然受孕婴儿面临更高的不良结局风险，其中出生体重异常尤为引人关注。作为ART过程中最显著区别于自然受孕的环节，胚胎培养介质可能通过表观遗传修饰等机制影响胎儿生长发育，但现有研究结论存在明显分歧。北京大学第三医院生殖医学中心的研究团队在《Human Reproduction Open》发表了一项突破性研究。该团队通过分析2010-2022年间23,403例新鲜胚胎移植周期的临床数据，系统评估了四种常用胚胎培养介质

  来源：Human Reproduction Open

  时间：2025-07-11

• 高效低成本直接空气捕获技术：超活性湿度摆动吸附膜的突破性研究

  全球气候变暖已成为人类面临的重大环境挑战，其中大气CO2浓度持续升高是主要驱动因素。直接空气捕获(Direct Air Capture, DAC)技术作为实现碳中和目标的关键手段，能够直接从环境空气中捕集CO2。然而现有技术面临两大瓶颈：传统温度摆动吸附(TSA)需要高能耗再生，而新兴湿度摆动吸附(Moisture Swing Adsorption, MSA)材料又存在活性组分负载量低、吸附动力学缓慢等问题。针对这一技术难题，浙江大学制冷与低温研究所的研究团队在《Nexus》发表创新成果。他们通过独特的PTFE纤维化工艺，开发出具有超高活性组分含量(99 wt%)的自支撑多孔薄膜材料。该研究突

  来源：Nexus

  时间：2025-07-11

• 基于全转录组与空间转录组技术的颅咽管瘤分子特征解析及其临床意义

  在脑肿瘤研究领域，颅咽管瘤(CPs)一直是个令人困惑的存在。这种被世界卫生组织(WHO)列为I级的良性肿瘤，却因其特殊的解剖位置——毗邻垂体和下丘脑，常常导致严重的内分泌功能障碍和生存质量下降。更令人困扰的是，临床上观察到两种截然不同的亚型：好发于儿童的造釉型颅咽管瘤(ACP)和成人多见的乳头型颅咽管瘤(PCP)，它们在分子水平上究竟有何不同？这个问题的答案，将直接影响临床诊断和治疗策略的选择。来自斯洛文尼亚卢布尔雅那大学医学院病理学研究所(Institute of Pathology, Faculty of Medicine, University of Ljubljana)的研究团队在《B

  来源：Brain Tumor Pathology

  时间：2025-07-11

• 德国生物质残渣资源化利用评估：面向碳中和的生物技术路径探索

  在全球资源消耗已超过地球可持续承载力1.7倍的背景下，如何实现经济系统的循环化转型成为紧迫课题。德国作为工业强国，其材料循环利用率仅为12.2%，远低于欧盟邻国，其中生物质资源的循环利用更是滞后，2019年利用率仅7.6%。这种现状与日益严峻的土地资源竞争形成尖锐矛盾，亟需开发不占用耕地的"零土地"解决方案。生物技术因其温和的反应条件和高效的资源转化特性，被认为是实现这一目标的关键路径——它能将传统上被焚烧或填埋的农业、林业和工业生物质残渣转化为高附加值化学品。德国亥姆霍兹环境研究中心(Helmholtz-Center for Environmental Research-UFZ)的研究团队在

  来源：Biotechnology for Biofuels and Bioproducts

  时间：2025-07-11

• 心血管疾病精准诊断新突破：98种代谢物同步检测的高通量HPLC-MS/MS方法学验证与临床应用

  心血管疾病的"沉默杀手"本质与代谢密码破译心血管疾病（CVD）作为全球首要死因，其早期诊断面临重大挑战——传统技术在亚临床阶段灵敏度不足，而代谢紊乱实为疾病发生的关键推手。心脏作为高能耗器官，依赖持续代谢底物供应，任何代谢通路异常（如脂肪酸氧化障碍、炎症信号放大）均可引发连锁病理反应。然而，现有靶向代谢组学方法存在三大局限：检测通量低（通常仅覆盖20-30种代谢物）、极性物质灵敏度不足、缺乏适用于多类别代谢物的无基质干扰校准方案，导致色氨酸通路关键分子（如犬尿氨酸）、内源性NOS抑制剂（ADMA/SDMA）及线粒体功能标记物（长链酰基肉碱）难以同步精准定量。为攻克这一技术壁垒，俄罗斯门捷列夫化

  来源：Journal of Chromatography B

  时间：2025-07-11

• 跨物种比较解析素E与D的生物合成：基于LC-MS技术的鱼类与人类细胞中α-亚麻酸代谢路径定量研究

  在生物体复杂的炎症调控网络中，解析素（Resolvins）作为一类由ω-3多不饱和脂肪酸衍生的脂质介质，扮演着"炎症刹车"的关键角色。尽管已知二十碳五烯酸（EPA）和二十二碳六烯酸（DHA）能分别转化为E系列（RvE）和D系列（RvD）解析素，但作为代谢前体的α-亚麻酸（ALA）如何在物种间实现转化效率差异，以及海洋鱼类与人类是否存在保守的代谢特征，始终是困扰研究人员的难题。更值得注意的是，现有技术对微量解析素的检测灵敏度不足，使得跨物种定量比较举步维艰。针对这些挑战，挪威海洋研究所（Institute of Marine Research, IMR）的Pedro Araujo团队在《Jour

  来源：Journal of Chromatography B

  时间：2025-07-11

• 生物炭-决明子-木霉三联疗法：鹰嘴豆白绢病可持续防控的创新策略

  在全球粮食安全面临严峻挑战的背景下，鹰嘴豆作为重要的蛋白质来源，其生产却长期受到土传病原体的威胁。其中由白绢病菌(Sclerotium rolfsii)引起的颈腐病可造成高达70%的产量损失，其产生的菌核结构能在土壤中存活三年以上，传统化学防治不仅效果有限，还带来环境污染和病原体抗药性问题。面对这一困境，印度勒克瑙大学的研究团队开创性地将农业废弃物转化产物、药用植物提取物和生防菌剂三者结合，探索出一条环境友好的综合治理路径。研究人员采用稻壳生物炭(RHB)作为载体基质，通过400℃热解制备获得碳含量52.3%的碱性(pH 8.2)材料，其159 m2/g的比表面和16.4 cmolc/kg的阳

  来源：BMC Plant Biology

  时间：2025-07-11

• 基于等离子体介孔金SERS生物传感器的卵巢癌源性细胞外囊泡检测技术

  摘要研究团队开发了一种基于等离子体介孔金（mAu）的表面增强拉曼光谱（SERS）生物传感器，用于检测卵巢癌（OC）患者体液中的胎盘碱性磷酸酶（PLAP）阳性细胞外囊泡（EVs）。EVs作为携带蛋白质、核酸等生物活性分子的脂质双层颗粒，能反映源细胞的生理状态。通过mAu的高表面粗糙度和孔隙结构产生的局域等离子体热点，该平台实现了100 EVs mL−1的超低检测限，临床验证中区分OC与良性/健康对照的灵敏度达90%，特异性达85%，性能显著优于传统CA-125检测。1 引言卵巢癌是全球女性第八大常见恶性肿瘤，早期诊断困难导致患者预后较差。EVs作为肿瘤细胞间通讯的关键媒介，其携带的PLAP在OC

  来源：Small

  时间：2025-07-11

• 甲状腺疾病患者对热消融技术的认知、态度及接受度调查：一项中国横断面研究

  甲状腺疾病在全球范围内呈现高发态势，其中甲状腺结节检出率高达60%，而传统手术和放射性碘治疗伴随的创伤风险、功能损伤等问题始终困扰着医患双方。尽管超声引导下的热消融技术（Thermal Ablation）如射频消融(RFA)、微波消融(MWA)等已被证实具有微创、保留甲状腺功能等优势，但患者对这一创新疗法的认知鸿沟成为临床推广的重要障碍。为破解这一难题，山东文登整骨烟台医院超声介入科与滨州医学院烟台附属医院的研究团队开展了一项开创性研究。他们采用横断面调查设计，于2022年10月至2023年3月期间对632名甲状腺疾病患者进行知识-态度-接受度(KAW)评估。研究结果发表于《Scientifi

  来源：Scientific Reports

  时间：2025-07-11

• "十秒技术(TST)联合Hybenx®凝胶与碳酸氢钠气流抛光在种植体表面去污染中的体外研究：一种新型种植体周围疾病管理策略"

  种植体周围疾病已成为口腔种植领域的主要挑战，研究显示种植体周围黏膜炎患病率高达45.8%，种植体周围炎达7.63%。传统机械清创联合局部抗菌剂治疗存在去污不彻底、损伤周围组织等问题，尤其对于复杂种植体表面结构。来自意大利私人诊所的Marianna De Nale团队在《Scientific Reports》发表研究，创新性提出十秒技术(TST)——通过Hybenx®凝胶10秒快速脱 biofilm 联合碳酸氢钠气流抛光的二步法，为种植体表面去污提供了新思路。研究采用扫描电镜(SEM)和能谱分析(EDX)技术，对两例因种植体周围炎拔除的钛种植体(酸蚀与喷砂酸蚀表面)进行TST处理前后的对比分析。

  来源：Scientific Reports

  时间：2025-07-11

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