PureTarget:一种无PCR扩增的保留甲基化信息的靶向测序方法,攻克神经系统疾病相关复杂基因

PureTarget:一种无PCR扩增的保留甲基化信息的靶向测序方法,攻克神经系统疾病相关复杂基因

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  讲座简介   

本视频中PacBio现场应用科学家Samantha Kalla对PureTarget做了详细介绍。PureTarget是PacBio推出的一种强大的、无PCR扩增的、可保留天然甲基化修饰的靶向测序方法。基于CRISPR-Cas9的技术对高分子量DNA直接进行靶标富集,通过高精准长读长HiFi测序实现对高GC含量区域、重复扩增区域等具有挑战性的复杂基因组区域的全面分析。

这种无PCR扩增的工作流程通过保留关键表观遗传信息和提升数据质量,展现出传统方法难以企及的优势。由于无需扩增,PureTarget避免了GC dropout、减少了对长片段大小的偏差,同时消除了PCR复制错误。该技术能对原始DNA分子进行高精准测序,这对研究大型复杂重复扩增等位基因尤为重要。整个工作流程(含测序与分析)可在约三天内完成从样本到答案的全过程。

该综合解决方案的核心是PureTarget Repeat Expansion Panel,可针对20个神经系统疾病相关基因进行分析。当在Revio或Vega系统上对48个样本进行混样检测时,该panel始终能实现高覆盖度。配套的串联重复基因分型工具——Tandem Repeat Genotyping Tool(TRGT)可支持下游分析,通过HiFi reads表征重复motif、等位基因长度及甲基化状态。

视频包含以下内容:
PureTarget 介绍
PureTarget PCR-Free 工作流程
PCR-Free 富集的主要优势
建议的上样DNA的质量
使用TRGT工具分析数据
PureTarget Repeat Expansion Panel介绍

  交流讨论   

  讲座介绍   

主讲人

PacBio应用科学家 Samantha Kalla

讲座题目:
PureTarget:一种无PCR扩增的保留甲基化信息的靶向测序方法,攻克神经系统疾病相关复杂基因


 

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