普洛麦格中文通讯 第六期 2003
一步到位的选择: GoTaq DNA 聚合酶
介绍GoTagTM DNA聚合酶:通过提供可选择的缓冲液改进扩增
美国普洛麦格公司:Amanda Glebs, B. S., Evelyn Stencel, B. S., and Kimberly Knoche, Ph.D.
 

摘要:
  GoTaqTM DNA聚合酶是Promega公司Taq DNA 聚合酶的新配置包装,其中提供了两种缓冲液——绿色GoTaqTM反应缓冲液(Green GoTaqTM Reaction Buffer)和无色GoTaqTM反应缓冲液(Cilirless GoTaqTM Reaction Buffer)。采用绿色GoTaqTM反应缓冲液和GoTaqTM DNA聚合酶扩增的PCR产物可直接上样到琼脂糖凝胶中进行电泳,省略了在电泳前需要向PCR产物中加入载样缓冲液这一步骤。如果PCR产物不需进行凝胶电泳或者绿色GoTaqTM反应缓冲液中的染料对PCR产物的下游应用有影响,则可使用试剂盒中提供的另一PCR反应缓冲液——无色GoTaqTM反应缓冲液。

使用GoTaqTM DNA聚合酶结合绿色GoTaqTM反应缓冲液进行PCR扩增,PCR产物可直接加入凝胶中电泳而无须和凝胶载样缓冲液混合。


前言:
   PR和RT-PCR是生物学研究中的常用技术,TaqDNA聚合酶是这些技术最常用的热稳定性DNA聚合酶。Promega公司更新了这一普遍使用的TaqDNA聚合酶的包装配置,新的包装中提供了两种新的反应缓冲液,其产品命名为GoTaqTM DNA聚合酶。
  一般研究者扩增DNA片段后,经常采用琼脂糖凝胶电泳方法分析扩增的DNA片段。为了提高该过程工作效率,我们研制开发了绿色GoTaqTM 反应缓冲液,当用于GoTaqTM DNA聚合酶扩增反应时,PCR产物可直接加入凝胶中电泳而无须和凝胶载样缓冲液混合。
  GoTaqTM DNA聚合酶系统包括适量的Taq DNA聚合酶,并提供了两种缓冲液,5X绿色GoTaqTM反应缓冲液和5X无色GoTaqTM反应缓冲液。当稀释到单倍浓度时,绿色GoTaqTM反应缓冲液具有足够的沉降度,可直接上样到琼脂糖凝胶和非变性TEB聚丙烯酰胺凝胶的胶孔中。这种缓冲液含有两种染料,在电泳

时分离产生一条蓝带和一条黄带,可用于监控电泳的过程。
  当扩增产物不经过纯化而直接进行吸光值和荧光值测定时,建议用5X无色的 GoTaqTM反应缓冲液和GoTaqTM DNA聚合酶进行扩增反应。无色GoTaqTM反应缓冲液和绿色GoTaqTM反应缓冲液的组成成分相同,只是不含有两种染料。两种5XGoTaqTM反应缓冲液中MgCl2的浓度都为7.5 mM, pH8.5 (即在1X缓冲液含有1.5 mM MgCl2 )。

  本文介绍了GoTaqTM DNA聚合酶及其反应缓冲液的特点,阐明了绿色 GoTaqTM反应缓冲液中染料的性质,对如何选择适当的缓冲液也进行了论述。另外我们将GoTaqTM DNA聚合酶的扩增特性和Promega公司其它Taq DNA聚合酶进行了比较,并报告了GoTaqTM DNA聚合酶和RT-PCR、T-载体克隆和其它应用的匹配特性。 

绿色GoTaqTM反应缓冲液
  5X绿色 GoTaqTM反应缓冲液的使用,去除了PCR产物在电泳前须加入载样缓冲液和染料这一步骤,并且胶孔中上样体积范围很大(图1,Panel A),可以通过查看缓冲液中两种染料来监控迁移速度(图2, Panel B)。在1%琼脂糖凝胶中,蓝色染料的迁移速率和3 - 5KB DNA片段相当,黄色染料的迁移速率比扩增用的引物迁移快(<50bp),以确保目的DNA片段保留在凝胶上,这种染料比Promega公司6Xblue/Orange电泳标准DNA分子(产品目录号:G1881)中的橙色染料迁移快。染料对琼脂糖凝胶中的DNA迁移没有影响;有染料存在时,片段和相应的标准DNA分子迁移相同的距离。当上样体积≦20μl时,和蓝色染料一同迁移的DNA片段不会被染料所覆盖。

反应缓冲液的选择:
  当PCR产物下游应用需要荧光或吸光值测定时建议不要使用5X绿色 GoTaq(tm)反应缓冲液。反应缓冲液中的染料在225和300nm有吸收光,从而DNA


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