蒺藜苜蓿microRNA 的全基因组鉴定

来自南京农业大学生命科学学院杨志敏教授领衔的团队在Plant Cell Environ最新9月刊上发表了有关蒺藜苜蓿microRNA的论文。杨教授的团队使用LC Sciences的Seq-Array方法，鉴定了蒺藜苜蓿（Medicago truncatula）中的新microRNA，并研究了miRNA的完整表达谱和复杂度，以及它们所对应的靶标。

　　

来自南京农业大学生命科学学院杨志敏教授领衔的团队在Plant Cell Environ最新9月刊上发表了有关蒺藜苜蓿microRNA的论文*。杨教授的团队使用LC Sciences的Seq-Array方法，鉴定了蒺藜苜蓿（Medicago truncatula）中的新microRNA（miRNA），并研究了miRNA的完整表达谱和复杂度，以及它们所对应的靶标。

作者设置了蒺藜苜蓿种子汞处理组和无汞对照组，以此建立了2个small RNA文库和2个降解组文库，并进行Illumina高通量测序。每个文库获取了约1千万的测序读数。

研究人员发现了至少52条长度约21个核苷酸的候选新miRNA与蒺藜苜蓿的基因组完全匹配。同时，发现201条miRNA代表63个已知的蒺藜苜蓿miRNA家族，包括尚未有过描述的12个保守miRNA和1个非保守miRNA。之后，研究人员利用高通量降解组测序策略鉴定出58个已知（37个保守和21个非保守）miRNA家族对应的130个靶标和18个新发现蒺藜苜蓿特有的候选miRNA家族对应的37个靶标。

为了分析miRNA表达谱，研究人员基于miRBase（http://microrna.sanger.ac.uk）中发布的miRNA和测序得到的新miRNA和候选序列设计探针，专门合成一款定制miRNA微阵列芯片进行实验（LC Sciences提供技术服务）。对候选新miRNA的转录本丰度进行的统计学分析发现，它们中的大多数能被重金属汞Hg(II)所调节，其中12个miRNA是因汞暴露特异诱发的。

点击索取miRNA微阵列芯片的更多资料

*Zhou ZS, HQ, Liu ZP, Yang ZM. (2011) Genome-wide identification of Medicago truncatula microRNAs and their targets reveals their differential regulation by heavy metal. Plant Cell Environ [Epub ahead of print].

关于LC Sciences与联川生物

LC Sciences（美国）是一家专业提供基因组及蛋白质组产品与服务的生物技术公司，提供下一代测序技术服务，全方位的DNA，RNA及多肽微阵列服务，可用于核酸/蛋白表达谱与功能分析，生物标记发现和新药筛选，研发应用于诊断和生物传感的微型实验设备。基于专利的µParaflo®微流体技术，LC Sciences可提供具有高度灵活性和定制化的创新产品来满足客户快速变化的需求。联川生物作为LC Sciences在中国成立的全资子公司，随时为您提供最新的生物技术服务和前沿信息。

欢迎拨打免费咨询热线：800-857-1452