北京生科所发表《Nature》文章最新统计

近期Natureasia公布了过去一年（2010年）当中，在Nature杂志上发表文章的亚太地区分布情况，从研究机构，国家和杂志各方面进行了排列。其中2010年发表Nature旗下期刊文章（包括Articles & Letters和Reviews）数量最多的研究机构是日本的东京大学，而在大陆地区，排名第一的是清华大学，其次是中科院，以及北京生命科学研究所。

　　

生物通报道：近期Natureasia公布了过去一年（2010年）当中，在Nature杂志上发表文章的亚太地区分布情况，从研究机构，国家和杂志各方面进行了排列。

文章的数量能反映这个特定的研究机构或者国家在这一领域的总共的文章数量，因此这一排序对于了解各国，已经各研究机构2010年所获得的成果具有重要的意义。

为了确保正确性，这一检索考虑了每个作者的附属机构，以及每个机构的作者百分比，每个作者在文章中的贡献大小没有列入考虑的范围，并且呈递地址也没有囊括进排列中。所有的文章排列分别考虑了Articles&Letters和Reviews。

在这些排名中，2010年发表Nature旗下期刊文章（包括Articles & Letters和Reviews）数量最多的研究机构是日本的东京大学（文章数量：92篇），其次是日本RIKEN（文章数量：47篇），第三是中国科学院（文章数量：44篇）。

其中北京生命科学研究所：

Crystal structure of the FTO protein reveals basis for its substrate specificity

这篇文章报导了肥胖相关基因FTO的晶体结构以及其对底物选择性的分子基础。柴继杰博士为文章的通讯作者。此项研究由科技部863计划、973计划，国家杰出青年科学基金和北京市科委资助，在北京生命科学研究所完成。

肥胖对人类健康有着重要的影响。2007年，人们利用全基因扫描技术发现FTO基因（FaT mass and Obesity associated）与肥胖密切相关。含有多态性SNP rs9939609的FTO基因纯合子的人群比不含有此等位基因的人群的平均体重重3KG。随后在不同的国家和民族（包括汉族）的调查都确证了此相关性。小鼠基因敲除实验也表明FTO基因与肥胖密切相关。随着对FTO基因功能研究的深入，生物信息学研究预测FTO基因编码一种依赖二价铁和酮戊二酸的一种双加氧酶，其底物主要是单链核酸上3-甲基化修饰的胸腺嘧啶或尿嘧啶。但是对其底物特异性性选择的分子机理还不清楚。

柴继杰实验室表达了人源FTO基因的蛋白，通过不同片段克隆与结晶条件的筛选，最终，利用NOG（一种α-酮戊二酸类似物，能与FTO结合但是酶反应不能进行）替代α-酮戊二酸获得了FTO蛋白与3-甲基化胸腺嘧啶核苷复合物的晶体结构。对结构的分析发现FTO基因N末端具有典型的依赖二价铁和酮戊二酸的一种双加氧酶特征外，结合生化实验，也揭示了FTO基因所独有的三点重要信息：第一， 由α-螺旋构成的C末端未知结构域对稳定N末端催化核心结构域具有重要作用。第二，FTO通过一个独有的长loop来达到选择单链修饰DNA或单链修饰RNA活性的结构基础。就我们目前所了解，FTO选择单双链的机理，是一种以前没有发现过的全新机理。第三，R96与3-meT的O2形成的氢键和Glu234主链的氨基N原子和3-meT的O4形成的氢键是FTO蛋白特异性识别3-甲基化修饰的U和T的主要结构基础。另外，结构与生化实验显示FTO 对3-甲基化修饰的U比T活性更强，提示在体内的生理条件下，甲基化的单链RNA可能是FTO的生理底物。

柴继杰实验室的结果也对FTO体内的功能方式有提示意义。因为体内甲基化的T很少。而3-甲基化修饰的U存在于核糖体等RNA中，结合其主要结合单链核酸的特性，提示FTO在体内可能通过影响修饰的核糖体的稳定性等来影响脂肪代谢，从而引起肥胖。我们复合物的结构也为设计通过干扰FTO的酶活性的小分子抑制剂提供了基础。

Structural basis for site-specific ribose methylation by box C/D RNA protein complexes

来自北京生命科学研究所的消息，北京生命科学研究所，中国医学科学院& 北京协和医学院的研究人员发表了题为“Structural basis for site-specific ribose methylation by box C/D RNA protein complexes”的文章，解析了C/D RNA蛋白质复合物催化RNA核糖甲基化的结构机理。

C/D RNA是普遍存在于真核生物和古细菌的一类古老的非编码RNA，它们主要介导核糖体RNA和剪切体RNA大量特定位点上的核糖甲基化修饰，同时参与真核生物核糖体的装配。在古细菌中，C/D RNA和甲基转移酶fibrillarin，RNA结合蛋白L7Ae和骨架蛋白Nop5形成复合物。C/D RNA能和修饰位点两边的碱基序列互补配对，而实现对底物的特异性选择。虽然对这个复合物的结构已经有较多研究，但二个基本问题仍然没有解决。首先C/D RNA是如何和蛋白质组装形成复合物的？其中经典的模型认为一条C/D RNA和两套蛋白结合形成所谓的“单体”结构，但是最近的研究认为两条C/D RNA和四套蛋白结合形成 “交叉双体”结构。第二个问题是C/D RNA如何指导甲基转移酶选择特定的修饰位点？

这一论文报道了一个加载了底物的完整C/D RNA蛋白质复合物的3.15埃晶体结构。其中晶体X光衍射数据在上海光源生物大分子晶体学线站BL17U搜集。该结构首次显示了这个复杂分子机器的整体组装方式，为“单体”模型提供了直接的证据。这个结构还清楚的显示了底物RNA的结合方式和催化亚基选择特定修饰位点的方式。作者还发现，为了形成催化所需的活性状态，底物的加载诱发了复合物内部结构发生广泛的变化。

（生物通：万纹）