两篇Science文章：头颈部鳞癌基因组新成果

　　

生物通报道  近期来自美国的两个研究团体利用高通量的新一代测序技术对采集的头颈部鳞癌样品的基因组进行了分析，从而为进一步深入了解头颈部鳞癌的发病演化机制提供了新线索。两篇研究论文同时发表在最新一期的《科学》（Science）杂志上。

生物通推荐原文摘要：

Exome Sequencing of Head and Neck Squamous Cell Carcinoma Reveals Inactivating Mutations in NOTCH1.Agrawal et al., 333 (6046): 1154-1157

The Mutational Landscape of Head and Neck Squamous Cell Carcinoma.Stransky et al., 333 (6046): 1157-1160

在全球范围内，头颈部鳞癌（Squamous cell carcinomas of the head and neck ，HNSCCs）是第6位常见的恶性肿瘤类型，每年约有60多万的新发病例。通常意义上的头颈部鳞癌是指发生指发生于口腔、咽部（鼻咽、口咽、下咽）及喉部的由鳞状上皮覆盖的恶性肿瘤。除了非角化型鼻咽癌以外，烟草和酒精是头颈部鳞癌的最主要发病因素。近年来的研究发现，人乳头状瘤病毒（HPV）与某些头颈部鳞癌特别是口咽癌的发生也有着有直接关系。目前对于头颈部鳞癌患者的治疗早期阶段主要是采取手术或放疗，晚期患者则主要是接受化疗结合局部放射性治疗。尽管如此，也只有40-50%的患者能够维持5年的生存期。

癌细胞与正常细胞行为不一样的遗传因素是癌细胞基因组里有一些基因突变。随着第二代测序技术在成本和数据产出上的巨大发展与突破，科学家们可以通过比较不同癌细胞和正常细胞的基因组，获得癌细胞中发生突变的基因，同时也可以了解这些突变发生的先后顺序，并结合演化的观点更为直接地推断肿瘤的演化过程。

在第一篇文章中，来自约翰霍普斯金大学医学院的Agrawal等利用全外显子组测序及基因拷贝数分析的方法对32个原发性头颈部鳞癌样品进行了分析，发现了6个与头颈部鳞癌发生相关的基因突变，除了从前已知的TP53, CDKN2A, PIK3CA和HRAS之外，FBXW7和NOTCH1为此次发现新基因突变。在另一组的88个头颈部鳞癌样品中Agrawal等再度重复验证了这一结果。

而在另一篇文章中来自哈佛-麻省理工博德研究所（Broad Institute of MIT and Harvard）的Stransky等对74组头颈部鳞癌与健康组织的样品进行了全外显子组测序分析，在TP53, CDKN2A, PIK3CA, PTEN和HRAS基因之外，研究人员还发现了大量与头颈部鳞癌相关的新基因。研究人员证实有30%的肿瘤样品中的突变基因参与调控了上皮细胞鳞状分化，其中包括NOTCH1, IRF6和TP63等。

在这两篇研究论文中，研究人员均证实NOTCH1基因与头颈部鳞癌密切相关——在10-15%的肿瘤中均存在NOTCH1基因失活性突变，这是仅次于TP53基因在肿瘤中发现的第二高频率突变基因。

新研究发现为科学家们深入地了解头颈部鳞癌的成因，寻找有效的癌症治疗靶点，推动开发出个体化的治疗策略提供了重要的研究数据。

（生物通：何嫱）