只花很少的钱也能做单细胞转录组分析了！

本周，Allen研究所和华盛顿大学的科学家在《Science》发表文章，一款用于描述成千上万细胞基因表达的低成本技术问世了。

　　

Single-Cell Transcriptome Landscape

基于分割池连接的转录组测序（Split Pool Ligation-based Transcriptome sequencing，SPLiT-seq）是一种可用于表征单细胞RNA的扩展技术，可用于识别组织内各种细胞类型。

“理解任何多细胞生命系统的前提是理解‘细胞’，” Allen研究所科学家Bosiljka Tasic说。“大脑富含许多不同形状和尺寸的细胞，对此我们缺乏通用的细胞描述和分类方法。表征单细胞RNA是公认的细胞分类方法之一，但它非常昂贵，而且需要专业设备。与现行方法不同，SPLiT-seq平台依托于任何实验室都有的基本设备，它将促进单细胞转录组学标准化，并将其真正的发扬光大。”

Bosiljka Tasic

早期开发的测序技术要求所有细胞必须在RNA标记之前就被分离开来。使用SPLiT-seq，细胞无需预先分离，细胞本身被视为RNA的天然隔离室。池中细胞被分割成多个小组，在那里RNA被贴上遗传条码。多次重复这个过程，直至每个细胞的RNA都被打上独特的组合条码，从而可同时对许多细胞的基因表达进行分类，将细胞分为不同类型。

“在这篇文章中，我们用SPLiT-seq分析了超过150,000个发育中的小鼠脑细胞，为特定细胞类型定义了很多新分子标志物，”华盛顿大学计算机科学与工程学院的合成生物学家Georg Seelig说。“每个细胞的花费仅为1分钱（人民币约6分钱），大大降低了实验室准备进行单细胞分析的成本门槛。”

“包括阿尔兹海默症和帕金斯在内，很多疾病研究都依赖人们对某些特定细胞类型的解读，”Tasic说。“深度了解哪些细胞哪里出了差错，将有利于理解功能障碍和疾病治疗。”

（生物通：伍松）