植物源天然化合物双重抑制SARS-CoV-2 Mpro与PLpro的计算发现与机制研究

本研究针对SARS-CoV-2病毒复制关键蛋白酶Mpro和PLpro，通过分子对接、药代动力学分析和分子动力学模拟，从110种天然化合物中筛选出具有高结合亲和力的潜在抑制剂，其中槲皮素衍生物M080（Astragalin）展现出优异的成药性，为COVID-19治疗提供了新型先导化合物。

　　

由严重急性呼吸综合征冠状病毒2型（SARS-CoV-2）引发的COVID-19全球大流行，凸显了开发靶向病毒蛋白酶的有效治疗剂的紧迫性。本研究从银杏（Ginkgo biloba）、白藓香（Lippia alba）、连钱草（Glechona hederacea）和蒙古栎树皮（Quercus mongolica）等植物中提取黄酮类、萜类、苯丙素类和甾体类天然化合物，系统评估其对SARS-CoV-2主要蛋白酶（Main Protease, M^pro，PDB ID: 7JN2）和木瓜样蛋白酶（Papain-Like Protease, PL^pro，PDB ID: 7K40）的抗病毒活性。

通过对110种抗凝血化合物进行分子对接分析，研究团队比较了它们与参考药物尼马特雷韦（Nirmatrelvir）的结合模式和亲和力。结果显示，芫花素（Genkwanin, M021）、木犀草素-7-O-(600-丙二酰葡萄糖苷)（Luteolin 7-O-(6′′-malonylglucoside), M072）和紫云英苷（Astragalin, M080）表现出显著的结合能力。其中，M080不仅符合利宾斯基五规则（Lipinski’s rule of five），具备良好的药代动力学特性，还在100纳秒分子动力学模拟中展现出与蛋白酶活性位点稳定的结合构象。

这项计算生物学研究揭示了天然化合物作为双重蛋白酶抑制剂的潜力，为开发针对SARS-CoV-2的新型抗病毒药物提供了具有前景的先导分子。