编辑推荐:
为探究金钗石斛(Dendrobium nobile Lindl)对干旱胁迫的调控机制,研究人员开展转录组和代谢组联合分析。结果发现精氨酸和脯氨酸代谢、硫代葡萄糖苷生物合成等途径参与调控。该研究为揭示金钗石斛抗旱机制提供理论依据。
在神奇的植物世界里,金钗石斛作为兰科石斛属的一员,不仅是珍贵的中药材,能养胃生津、明目润肺,还凭借其美丽的花姿具有观赏价值。它常附生在树木或岩石缝隙中,独特的生长环境使其常遭受干旱胁迫。目前,虽然对铁皮石斛等其他石斛属植物的干旱研究有一定进展,但金钗石斛应对干旱胁迫的具体调控机制却尚未明晰,这就像一团迷雾,笼罩在科研人员心头。为了驱散这团迷雾,遵义师范学院的研究人员勇挑重担,开展了一项意义非凡的研究。他们对不同干旱胁迫条件下的金钗石斛茎进行转录组和代谢组联合分析,试图揭开金钗石斛抗旱机制的神秘面纱。这项研究成果发表在《BMC Plant Biology》上,为深入了解植物应对干旱胁迫的机制提供了重要线索。
研究人员在本次研究中,运用了多种关键技术方法。在样本采集方面,选取来自贵州赤水市旺隆镇石斛种植基地的金钗石斛盆栽苗,设置对照(CK)、干旱处理 20 天(D20)、40 天(D40)和 60 天(D60)四个处理组。通过 RNA 测序(RNA-seq)技术获取转录组数据,利用液相色谱 - 质谱联用(LC-MS)技术分析代谢组。同时,借助加权基因共表达网络分析(WGCNA)等方法,构建基因与代谢物的调控网络。
研究结果如下:
- 不同干旱胁迫条件下金钗石斛的特征变化:随着干旱处理时间延长,金钗石斛叶片逐渐变黄,生长受抑制,土壤和茎的含水量下降,部分生理指标如可溶性糖(WSS)、抗坏血酸(VC)等含量发生改变。这表明干旱对金钗石斛的生长和生理状态产生了显著影响。
- 转录组变化:转录组测序后经质量控制,平均每个样本获得 1310 万个 clean reads,映射率达 86.3%。主成分分析(PCA)显示组内样本聚集,组间分离。差异表达分析发现 CK 与 D60 组间差异表达基因(DEGs)最多。KEGG 富集分析表明,DEGs 在植物激素信号转导、角质、木栓质和蜡生物合成等多个途径富集。这说明在干旱胁迫下,金钗石斛的基因表达发生了广泛变化,涉及多个生理过程的调控。
- 代谢组变化:基于二级质谱鉴定出 475 种代谢物。CK 与 D60、D20 与 D60 之间差异丰度代谢物(DAMs)最多。KEGG 分析显示,DAMs 在硫代葡萄糖苷生物合成、氰基氨基酸代谢等途径富集。这揭示了干旱胁迫下金钗石斛代谢物的变化规律及其参与的代谢途径。
- STEM 分析:对 DEGs 和 DAMs 进行 STEM 分析,发现多个显著富集的基因和代谢物表达趋势。如基因在植物激素信号转导等途径富集,代谢物在硫代葡萄糖苷生物合成等途径富集。这进一步明确了干旱胁迫下基因和代谢物的动态变化与相关代谢途径的关联。
- WGCNA 分析:WGCNA 将 DEGs 分为十个模块,部分模块与生理性状显著相关。如 MEblue、MEorangered4 和 MElightcyan 模块与 WSS、VC 和叶绿素 B(ChlB)呈正相关。同时,特定模块与干旱胁迫相关途径存在联系。这为构建干旱胁迫下金钗石斛的基因调控网络提供了重要依据。
- 基因调控网络:研究确定了与干旱耐受性相关的关键基因和代谢物。在精氨酸和脯氨酸代谢途径中,ALDH18A、rocF 等基因表达上调;硫代葡萄糖苷生物合成途径中,MAM1 基因和部分代谢物上调;酪氨酸代谢途径中,多酚氧化酶等基因表达增加。这些基因和代谢物共同参与金钗石斛对干旱胁迫的调控。
综合研究结论和讨论部分,本研究成功揭示了金钗石斛应对干旱胁迫的关键基因调控网络。研究发现精氨酸和脯氨酸代谢、硫代葡萄糖苷生物合成和酪氨酸代谢途径在干旱胁迫调控中发挥重要作用。这些发现为深入理解金钗石斛的抗旱机制提供了理论基础,有助于后续通过基因工程等手段提高金钗石斛的抗旱能力,对保护和培育这一珍贵的药用植物资源具有重要意义。同时,该研究也为其他植物应对干旱胁迫的研究提供了参考,拓展了植物抗逆研究的思路和方向。