新发现!FBN1 内含子变异通过框内外显子跳跃引发单纯性晶状体异位

【字体: 时间:2025年02月14日 来源:Journal of Human Genetics 2.6

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  为解决 FBN1 基因突变相关疾病基因型 - 表型关系未明的问题,研究人员对一个日本三代单纯性晶状体异位(IEL)家族开展研究。发现 FBN1 基因内含子新变异 c.1327+3A>C 可致 IEL,该成果有助于深入理解 FBN1 相关疾病。

  在人体的奇妙世界里,眼睛就像一扇心灵之窗,而晶状体则是这扇窗上的关键 “镜片”。一旦晶状体出现问题,就可能引发各种眼部疾病,其中晶状体异位(Ectopia lentis,EL)就是一种较为棘手的病症。它不仅会导致视力下降,还可能引发瞳孔阻滞性青光眼、视网膜损伤甚至失明等严重并发症。
EL 的出现原因多样,其中遗传因素占据了重要地位。FBN1 基因编码的原纤维蛋白 - 1(fibrillin - 1)是一种结构蛋白,它聚合形成微原纤维,广泛存在于所有结缔组织中,对维持组织的正常结构和功能起着关键作用。然而,FBN1 基因突变会引发多种疾病,如马凡综合征(Marfan syndrome,MFS)、韦尔 - 马凯萨尼综合征 2(Weill–Marchesani syndrome 2,WMS2)等,这些疾病的症状复杂多样,涉及多个器官系统。尽管已经发现了超过 1000 种 FBN1 致病突变,但基因型与表型之间的关系却如同迷雾,尚未完全明晰。这不仅给疾病的诊断和治疗带来了巨大挑战,也阻碍了对这些疾病发病机制的深入理解。

为了驱散这层迷雾,来自日本多所研究机构(千叶大学医学院、名古屋大学等)的研究人员勇敢地踏上了探索之旅。他们将目光聚焦于一个日本三代家族,这个家族中出现了多名单纯性晶状体异位(Isolated Ectopia Lentis,IEL)患者,IEL 是指患者除了眼睛出现晶状体异位外,其他器官并无明显异常表现。

研究人员通过一系列严谨的研究,最终得出了令人振奋的结论:他们发现了 FBN1 基因内含子 11 中的一个新的单核苷酸变异(c.1327+3A>C),这个变异与 IEL 紧密相关。这一发现就像是在黑暗中点亮了一盏明灯,为深入理解 FBN1 相关疾病的发病机制提供了新的线索,也为 IEL 的诊断和治疗开辟了新的方向。该研究成果发表在《Journal of Human Genetics》上。

在研究过程中,研究人员主要运用了以下几种关键技术方法:首先是全外显子测序(Whole - exome sequencing,WES),对家族中部分成员的基因组 DNA 进行测序,筛选可能的致病基因变异;接着利用聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)直接测序,对候选变异在其他家族成员中进行验证;然后通过逆转录聚合酶链反应(Reverse transcription - polymerase chain reaction,RT - PCR)分析 FBN1 转录本的剪接情况;最后构建 FBN1 迷你基因模型,在体外验证变异对前体 mRNA 剪接的影响 。

研究结果


  1. 临床特征:对四位有 EL 病史的家族成员进行详细的眼科、心脏和骨科检查。结果显示,他们均无 MFS 和 WMS 相关的心血管、骨骼及眼部其他异常,仅表现为晶状体异位及相关眼部并发症,如眼压升高、视力下降等。
  2. 遗传分析:WES 未发现之前已知的与遗传性晶状体脱位相关的编码变异。但在 IV - 1 和 III - 2 中均检测到 FBN1 基因第 11 内含子第 3 个核苷酸由 A 突变为 C(c.1327+3A>C)的杂合变异。该变异在 CADD 工具预测中具有高度有害性,SpliceAI 和 MMSplice 评分表明其可能影响剪接。进一步通过 Sanger 测序证实家族中其他患病个体 II - 2 和 III - 3 也携带该变异。
  3. FBN1 转录本分析:对健康个体外周血单个核细胞(PBMCs)的 FBN1 转录本进行 RT - PCR,仅检测到单一大小的扩增子。而四位患病个体的 PBMCs 中,RT - PCR 检测到多条不同迁移率的条带。经 Sanger 测序,较小条带对应缺失外显子 11 的 FBN1 转录本,涂抹条带则来自包含或不包含外显子 11 跳跃的扩增子复合物。
  4. 迷你基因模型剪接分析:构建野生型(WT)、c.1327+3A>C 突变型和之前报道的与 EL 相关的 c.1327+1G>A 突变型迷你基因。转染 HEK293 细胞后进行 RT - PCR 和琼脂糖凝胶电泳分析,结果显示 WT 迷你基因转录本正常剪接,而 c.1327+3A>C 和 c.1327+1G>A 突变型迷你基因转录本均缺失外显子 11,与患者 PBMCs 转录本结果一致。

研究结论与讨论


研究发现 FBN1 基因内含子变异 c.1327+3A>C 通过导致外显子 11 跳跃,引起框内缺失 60 个氨基酸,进而引发 IEL。此前报道的 c.1327+1G>A 变异也有类似作用,二者均影响 FBN1 基因第 11 内含子的剪接。外显子 11 编码的部分氨基酸对应 FBN1 蛋白的富含脯氨酸区域,该区域可能在蛋白折叠和微原纤维组装中起 “铰链” 作用。虽然推测该变异致病机制可能是突变蛋白的显性负效应(Dominant - negative effect,DN)而非单倍体不足(Haploinsufficiency,HI),但由于实验限制,不能完全排除 HI 的可能性。此外,该变异还有可能诱导异常剪接,涉及内含子 11 保留、额外外显子或隐蔽剪接位点的使用。

这项研究意义重大,它首次揭示了 FBN1 基因内含子新变异 c.1327+3A>C 与 IEL 的关联,为 IEL 的遗传学诊断提供了新的依据。同时,对 FBN1 基因功能和致病机制的深入理解,有助于进一步明确 FBN1 相关疾病的基因型 - 表型关系,为未来开发更精准的诊断方法和个性化治疗策略奠定了坚实基础。

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